Protein–RNA interactions for Protein: P24610

Pax3, Paired box protein Pax-3, mousemouse

Predictions only

Length 479 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pax3P24610 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pax3P24610 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pax3P24610 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pax3P24610 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pax3P24610 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Pax3P24610 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pax3P24610 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Pax3P24610 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pax3P24610 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pax3P24610 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pax3P24610 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pax3P24610 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pax3P24610 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pax3P24610 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pax3P24610 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pax3P24610 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pax3P24610 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pax3P24610 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pax3P24610 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pax3P24610 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pax3P24610 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pax3P24610 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pax3P24610 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pax3P24610 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pax3P24610 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pax3P24610 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Pax3P24610 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pax3P24610 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pax3P24610 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pax3P24610 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pax3P24610 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pax3P24610 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pax3P24610 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pax3P24610 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pax3P24610 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pax3P24610 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pax3P24610 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pax3P24610 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pax3P24610 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pax3P24610 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pax3P24610 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pax3P24610 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pax3P24610 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pax3P24610 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.19
Pax3P24610 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pax3P24610 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pax3P24610 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pax3P24610 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pax3P24610 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pax3P24610 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pax3P24610 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pax3P24610 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pax3P24610 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pax3P24610 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pax3P24610 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pax3P24610 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pax3P24610 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pax3P24610 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pax3P24610 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pax3P24610 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pax3P24610 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pax3P24610 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pax3P24610 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pax3P24610 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pax3P24610 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pax3P24610 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pax3P24610 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pax3P24610 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pax3P24610 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Pax3P24610 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pax3P24610 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pax3P24610 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pax3P24610 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pax3P24610 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Pax3P24610 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pax3P24610 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pax3P24610 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pax3P24610 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pax3P24610 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pax3P24610 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pax3P24610 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pax3P24610 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Pax3P24610 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pax3P24610 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pax3P24610 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pax3P24610 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pax3P24610 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pax3P24610 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Pax3P24610 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Pax3P24610 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Pax3P24610 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Pax3P24610 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Pax3P24610 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Pax3P24610 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Pax3P24610 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pax3P24610 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pax3P24610 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pax3P24610 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pax3P24610 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pax3P24610 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 89.9 ms