Protein–RNA interactions for Protein: P23611

Irf8, Interferon regulatory factor 8, mousemouse

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irf8P23611 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Irf8P23611 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Irf8P23611 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Irf8P23611 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Irf8P23611 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Irf8P23611 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Irf8P23611 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Irf8P23611 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Irf8P23611 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Irf8P23611 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Irf8P23611 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Irf8P23611 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Irf8P23611 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Irf8P23611 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Irf8P23611 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Irf8P23611 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Irf8P23611 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Irf8P23611 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Irf8P23611 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Irf8P23611 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Irf8P23611 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Irf8P23611 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Irf8P23611 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Irf8P23611 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Irf8P23611 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Irf8P23611 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Irf8P23611 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Irf8P23611 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Irf8P23611 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Irf8P23611 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Irf8P23611 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Irf8P23611 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Irf8P23611 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Irf8P23611 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Irf8P23611 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Irf8P23611 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Irf8P23611 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Irf8P23611 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Irf8P23611 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Irf8P23611 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Irf8P23611 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Irf8P23611 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Irf8P23611 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Irf8P23611 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Irf8P23611 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Irf8P23611 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Irf8P23611 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Irf8P23611 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Irf8P23611 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Irf8P23611 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Irf8P23611 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Irf8P23611 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Irf8P23611 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Irf8P23611 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Irf8P23611 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Irf8P23611 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Irf8P23611 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Irf8P23611 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Irf8P23611 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Irf8P23611 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Irf8P23611 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Irf8P23611 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Irf8P23611 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Irf8P23611 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Irf8P23611 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Irf8P23611 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Irf8P23611 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Irf8P23611 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Irf8P23611 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Irf8P23611 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Irf8P23611 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Irf8P23611 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Irf8P23611 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Irf8P23611 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Irf8P23611 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Irf8P23611 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Irf8P23611 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Irf8P23611 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Irf8P23611 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Irf8P23611 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Irf8P23611 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Irf8P23611 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Irf8P23611 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Irf8P23611 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Irf8P23611 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Irf8P23611 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Irf8P23611 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Irf8P23611 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Irf8P23611 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Irf8P23611 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Irf8P23611 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Irf8P23611 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Irf8P23611 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Irf8P23611 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Irf8P23611 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Irf8P23611 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Irf8P23611 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Irf8P23611 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Irf8P23611 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Irf8P23611 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.4 ms