Protein–RNA interactions for Protein: P21958

Tap1, Antigen peptide transporter 1, mousemouse

Predictions only

Length 724 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tap1P21958 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tap1P21958 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tap1P21958 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Tap1P21958 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Tap1P21958 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Tap1P21958 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Tap1P21958 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Tap1P21958 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Tap1P21958 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Tap1P21958 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tap1P21958 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tap1P21958 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Tap1P21958 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tap1P21958 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tap1P21958 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tap1P21958 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tap1P21958 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tap1P21958 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tap1P21958 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tap1P21958 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tap1P21958 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tap1P21958 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tap1P21958 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tap1P21958 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tap1P21958 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tap1P21958 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tap1P21958 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tap1P21958 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Tap1P21958 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Tap1P21958 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Tap1P21958 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tap1P21958 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tap1P21958 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tap1P21958 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tap1P21958 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tap1P21958 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tap1P21958 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tap1P21958 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tap1P21958 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tap1P21958 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tap1P21958 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tap1P21958 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tap1P21958 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tap1P21958 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tap1P21958 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Tap1P21958 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Tap1P21958 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Tap1P21958 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tap1P21958 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tap1P21958 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tap1P21958 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tap1P21958 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tap1P21958 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tap1P21958 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tap1P21958 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tap1P21958 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tap1P21958 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tap1P21958 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tap1P21958 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tap1P21958 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tap1P21958 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tap1P21958 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tap1P21958 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tap1P21958 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tap1P21958 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tap1P21958 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tap1P21958 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tap1P21958 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Tap1P21958 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tap1P21958 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tap1P21958 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tap1P21958 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tap1P21958 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tap1P21958 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tap1P21958 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tap1P21958 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tap1P21958 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tap1P21958 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tap1P21958 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Tap1P21958 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tap1P21958 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tap1P21958 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tap1P21958 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Tap1P21958 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Tap1P21958 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Tap1P21958 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Tap1P21958 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Tap1P21958 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tap1P21958 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tap1P21958 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Tap1P21958 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tap1P21958 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tap1P21958 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tap1P21958 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tap1P21958 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tap1P21958 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tap1P21958 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tap1P21958 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tap1P21958 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tap1P21958 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms