Protein–RNA interactions for Protein: P20937

Klra1, T-cell surface glycoprotein YE1/48, mousemouse

Predictions only

Length 262 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klra1P20937 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Klra1P20937 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Klra1P20937 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Klra1P20937 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Klra1P20937 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Klra1P20937 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Klra1P20937 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Klra1P20937 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Klra1P20937 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Klra1P20937 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Klra1P20937 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Klra1P20937 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Klra1P20937 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Klra1P20937 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Klra1P20937 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Klra1P20937 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Klra1P20937 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Klra1P20937 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Klra1P20937 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Klra1P20937 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Klra1P20937 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Klra1P20937 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Klra1P20937 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Klra1P20937 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Klra1P20937 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Klra1P20937 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Klra1P20937 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Klra1P20937 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Klra1P20937 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Klra1P20937 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Klra1P20937 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Klra1P20937 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Klra1P20937 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Klra1P20937 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Klra1P20937 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Klra1P20937 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Klra1P20937 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Klra1P20937 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Klra1P20937 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Klra1P20937 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Klra1P20937 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Klra1P20937 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Klra1P20937 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Klra1P20937 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Klra1P20937 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Klra1P20937 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Klra1P20937 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Klra1P20937 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Klra1P20937 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Klra1P20937 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Klra1P20937 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Klra1P20937 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Klra1P20937 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Klra1P20937 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Klra1P20937 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Klra1P20937 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Klra1P20937 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Klra1P20937 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Klra1P20937 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Klra1P20937 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Klra1P20937 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Klra1P20937 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Klra1P20937 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Klra1P20937 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Klra1P20937 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Klra1P20937 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Klra1P20937 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Klra1P20937 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Klra1P20937 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Klra1P20937 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Klra1P20937 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Klra1P20937 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Klra1P20937 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Klra1P20937 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Klra1P20937 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Klra1P20937 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Klra1P20937 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Klra1P20937 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Klra1P20937 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Klra1P20937 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Klra1P20937 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Klra1P20937 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Klra1P20937 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Klra1P20937 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Klra1P20937 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Klra1P20937 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Klra1P20937 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Klra1P20937 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Klra1P20937 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Klra1P20937 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Klra1P20937 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Klra1P20937 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Klra1P20937 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Klra1P20937 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Klra1P20937 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Klra1P20937 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Klra1P20937 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Klra1P20937 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Klra1P20937 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Klra1P20937 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms