Protein–RNA interactions for Protein: P20490

Ms4a2, High affinity immunoglobulin epsilon receptor subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a2P20490 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ms4a2P20490 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ms4a2P20490 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ms4a2P20490 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ms4a2P20490 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ms4a2P20490 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ms4a2P20490 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ms4a2P20490 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ms4a2P20490 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ms4a2P20490 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ms4a2P20490 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ms4a2P20490 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ms4a2P20490 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ms4a2P20490 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ms4a2P20490 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ms4a2P20490 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ms4a2P20490 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ms4a2P20490 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ms4a2P20490 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ms4a2P20490 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ms4a2P20490 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ms4a2P20490 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ms4a2P20490 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Ms4a2P20490 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ms4a2P20490 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Ms4a2P20490 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ms4a2P20490 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ms4a2P20490 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ms4a2P20490 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ms4a2P20490 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ms4a2P20490 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ms4a2P20490 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ms4a2P20490 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ms4a2P20490 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ms4a2P20490 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ms4a2P20490 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ms4a2P20490 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ms4a2P20490 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ms4a2P20490 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ms4a2P20490 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ms4a2P20490 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ms4a2P20490 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ms4a2P20490 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ms4a2P20490 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ms4a2P20490 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ms4a2P20490 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ms4a2P20490 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ms4a2P20490 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ms4a2P20490 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ms4a2P20490 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ms4a2P20490 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ms4a2P20490 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ms4a2P20490 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Ms4a2P20490 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ms4a2P20490 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ms4a2P20490 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ms4a2P20490 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ms4a2P20490 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ms4a2P20490 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ms4a2P20490 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ms4a2P20490 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ms4a2P20490 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ms4a2P20490 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ms4a2P20490 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Ms4a2P20490 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ms4a2P20490 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ms4a2P20490 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ms4a2P20490 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ms4a2P20490 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ms4a2P20490 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ms4a2P20490 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ms4a2P20490 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Ms4a2P20490 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Ms4a2P20490 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ms4a2P20490 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ms4a2P20490 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ms4a2P20490 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
Ms4a2P20490 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ms4a2P20490 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
Ms4a2P20490 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ms4a2P20490 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ms4a2P20490 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ms4a2P20490 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ms4a2P20490 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ms4a2P20490 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ms4a2P20490 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ms4a2P20490 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ms4a2P20490 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ms4a2P20490 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ms4a2P20490 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ms4a2P20490 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ms4a2P20490 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ms4a2P20490 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ms4a2P20490 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ms4a2P20490 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ms4a2P20490 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ms4a2P20490 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ms4a2P20490 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ms4a2P20490 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ms4a2P20490 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms