Protein–RNA interactions for Protein: P20444

Prkca, Protein kinase C alpha type, mousemouse

Predictions only

Length 672 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcaP20444 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PrkcaP20444 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PrkcaP20444 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PrkcaP20444 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PrkcaP20444 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PrkcaP20444 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
PrkcaP20444 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PrkcaP20444 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PrkcaP20444 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PrkcaP20444 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PrkcaP20444 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PrkcaP20444 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PrkcaP20444 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PrkcaP20444 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PrkcaP20444 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PrkcaP20444 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PrkcaP20444 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PrkcaP20444 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PrkcaP20444 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PrkcaP20444 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PrkcaP20444 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PrkcaP20444 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PrkcaP20444 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PrkcaP20444 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PrkcaP20444 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PrkcaP20444 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PrkcaP20444 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PrkcaP20444 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PrkcaP20444 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PrkcaP20444 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PrkcaP20444 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PrkcaP20444 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PrkcaP20444 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PrkcaP20444 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PrkcaP20444 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PrkcaP20444 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PrkcaP20444 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PrkcaP20444 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PrkcaP20444 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
PrkcaP20444 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PrkcaP20444 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PrkcaP20444 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PrkcaP20444 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PrkcaP20444 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PrkcaP20444 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PrkcaP20444 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PrkcaP20444 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PrkcaP20444 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PrkcaP20444 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PrkcaP20444 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PrkcaP20444 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PrkcaP20444 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PrkcaP20444 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
PrkcaP20444 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
PrkcaP20444 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PrkcaP20444 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
PrkcaP20444 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PrkcaP20444 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PrkcaP20444 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PrkcaP20444 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PrkcaP20444 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PrkcaP20444 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PrkcaP20444 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PrkcaP20444 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PrkcaP20444 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PrkcaP20444 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PrkcaP20444 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PrkcaP20444 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PrkcaP20444 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PrkcaP20444 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PrkcaP20444 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
PrkcaP20444 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PrkcaP20444 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PrkcaP20444 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PrkcaP20444 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PrkcaP20444 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PrkcaP20444 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PrkcaP20444 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
PrkcaP20444 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PrkcaP20444 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PrkcaP20444 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PrkcaP20444 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PrkcaP20444 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PrkcaP20444 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PrkcaP20444 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PrkcaP20444 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PrkcaP20444 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PrkcaP20444 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PrkcaP20444 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PrkcaP20444 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PrkcaP20444 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PrkcaP20444 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PrkcaP20444 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PrkcaP20444 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PrkcaP20444 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PrkcaP20444 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PrkcaP20444 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PrkcaP20444 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PrkcaP20444 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PrkcaP20444 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.6 ms