Protein–RNA interactions for Protein: P20443

Sag, S-arrestin, mousemouse

Predictions only

Length 403 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SagP20443 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SagP20443 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SagP20443 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SagP20443 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SagP20443 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SagP20443 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SagP20443 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SagP20443 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SagP20443 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
SagP20443 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SagP20443 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SagP20443 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SagP20443 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SagP20443 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SagP20443 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SagP20443 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SagP20443 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SagP20443 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SagP20443 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
SagP20443 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SagP20443 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SagP20443 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SagP20443 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SagP20443 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SagP20443 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SagP20443 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SagP20443 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SagP20443 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SagP20443 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SagP20443 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
SagP20443 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SagP20443 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
SagP20443 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SagP20443 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SagP20443 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SagP20443 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SagP20443 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SagP20443 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SagP20443 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SagP20443 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SagP20443 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SagP20443 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SagP20443 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SagP20443 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SagP20443 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SagP20443 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SagP20443 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SagP20443 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SagP20443 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SagP20443 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SagP20443 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SagP20443 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SagP20443 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
SagP20443 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SagP20443 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SagP20443 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SagP20443 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SagP20443 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SagP20443 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SagP20443 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SagP20443 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SagP20443 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SagP20443 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SagP20443 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SagP20443 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
SagP20443 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SagP20443 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SagP20443 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SagP20443 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SagP20443 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SagP20443 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SagP20443 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SagP20443 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SagP20443 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SagP20443 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SagP20443 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SagP20443 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SagP20443 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SagP20443 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SagP20443 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SagP20443 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SagP20443 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SagP20443 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SagP20443 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SagP20443 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SagP20443 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
SagP20443 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SagP20443 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SagP20443 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SagP20443 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
SagP20443 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SagP20443 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
SagP20443 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SagP20443 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SagP20443 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SagP20443 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SagP20443 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SagP20443 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SagP20443 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SagP20443 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms