Protein–RNA interactions for Protein: P18533

Ig heavy chain V region 733, mousemouse

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Length 117 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18533 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
P18533 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
P18533 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
P18533 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
P18533 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
P18533 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
P18533 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
P18533 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
P18533 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
P18533 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
P18533 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
P18533 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
P18533 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
P18533 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
P18533 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
P18533 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
P18533 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
P18533 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
P18533 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
P18533 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
P18533 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
P18533 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
P18533 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
P18533 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
P18533 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
P18533 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
P18533 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
P18533 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
P18533 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
P18533 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
P18533 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
P18533 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
P18533 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
P18533 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
P18533 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
P18533 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
P18533 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
P18533 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
P18533 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
P18533 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
P18533 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
P18533 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
P18533 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
P18533 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
P18533 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
P18533 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
P18533 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
P18533 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
P18533 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
P18533 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
P18533 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
P18533 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
P18533 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
P18533 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
P18533 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
P18533 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
P18533 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
P18533 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
P18533 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
P18533 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
P18533 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
P18533 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
P18533 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
P18533 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
P18533 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
P18533 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
P18533 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
P18533 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
P18533 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
P18533 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
P18533 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
P18533 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
P18533 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
P18533 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
P18533 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
P18533 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
P18533 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
P18533 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
P18533 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
P18533 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
P18533 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
P18533 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
P18533 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
P18533 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
P18533 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
P18533 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
P18533 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
P18533 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
P18533 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
P18533 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
P18533 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
P18533 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
P18533 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
P18533 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
P18533 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
P18533 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
P18533 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
P18533 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
P18533 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
P18533 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms