Protein–RNA interactions for Protein: P17532

Tph1, Tryptophan 5-hydroxylase 1, mousemouse

Predictions only

Length 447 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tph1P17532 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Tph1P17532 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Tph1P17532 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Tph1P17532 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Tph1P17532 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Tph1P17532 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Tph1P17532 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Tph1P17532 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Tph1P17532 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Tph1P17532 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Tph1P17532 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Tph1P17532 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Tph1P17532 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Tph1P17532 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Tph1P17532 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Tph1P17532 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Tph1P17532 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Tph1P17532 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Tph1P17532 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Tph1P17532 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Tph1P17532 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Tph1P17532 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Tph1P17532 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Tph1P17532 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Tph1P17532 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Tph1P17532 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Tph1P17532 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Tph1P17532 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Tph1P17532 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Tph1P17532 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Tph1P17532 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Tph1P17532 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Tph1P17532 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Tph1P17532 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Tph1P17532 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Tph1P17532 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Tph1P17532 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Tph1P17532 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Tph1P17532 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Tph1P17532 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Tph1P17532 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Tph1P17532 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Tph1P17532 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Tph1P17532 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Tph1P17532 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Tph1P17532 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Tph1P17532 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Tph1P17532 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Tph1P17532 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Tph1P17532 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Tph1P17532 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Tph1P17532 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Tph1P17532 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Tph1P17532 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Tph1P17532 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Tph1P17532 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Tph1P17532 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Tph1P17532 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Tph1P17532 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Tph1P17532 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Tph1P17532 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Tph1P17532 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Tph1P17532 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Tph1P17532 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Tph1P17532 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Tph1P17532 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Tph1P17532 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Tph1P17532 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Tph1P17532 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Tph1P17532 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Tph1P17532 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Tph1P17532 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Tph1P17532 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Tph1P17532 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Tph1P17532 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Tph1P17532 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Tph1P17532 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Tph1P17532 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Tph1P17532 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Tph1P17532 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Tph1P17532 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Tph1P17532 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Tph1P17532 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Tph1P17532 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Tph1P17532 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Tph1P17532 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Tph1P17532 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Tph1P17532 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Tph1P17532 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Tph1P17532 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Tph1P17532 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Tph1P17532 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Tph1P17532 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Tph1P17532 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Tph1P17532 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Tph1P17532 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tph1P17532 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tph1P17532 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tph1P17532 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tph1P17532 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 94.9 ms