Protein–RNA interactions for Protein: P13864

Dnmt1, DNA (cytosine-5)-methyltransferase 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnmt1P13864 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
Dnmt1P13864 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
Dnmt1P13864 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
Dnmt1P13864 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
Dnmt1P13864 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
Dnmt1P13864 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
Dnmt1P13864 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
Dnmt1P13864 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC33.79■■■■□ 3
Dnmt1P13864 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC33.79■■■■□ 3
Dnmt1P13864 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
Dnmt1P13864 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
Dnmt1P13864 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
Dnmt1P13864 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
Dnmt1P13864 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
Dnmt1P13864 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
Dnmt1P13864 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC33.77■■■■□ 3
Dnmt1P13864 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
Dnmt1P13864 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
Dnmt1P13864 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.75■■■□□ 2.99
Dnmt1P13864 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.75■■■□□ 2.99
Dnmt1P13864 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
Dnmt1P13864 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
Dnmt1P13864 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
Dnmt1P13864 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
Dnmt1P13864 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
Dnmt1P13864 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
Dnmt1P13864 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
Dnmt1P13864 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
Dnmt1P13864 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC33.73■■■□□ 2.99
Dnmt1P13864 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
Dnmt1P13864 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
Dnmt1P13864 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
Dnmt1P13864 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.71■■■□□ 2.99
Dnmt1P13864 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
Dnmt1P13864 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.71■■■□□ 2.99
Dnmt1P13864 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC33.71■■■□□ 2.99
Dnmt1P13864 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC33.71■■■□□ 2.99
Dnmt1P13864 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
Dnmt1P13864 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC33.71■■■□□ 2.99
Dnmt1P13864 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
Dnmt1P13864 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
Dnmt1P13864 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
Dnmt1P13864 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
Dnmt1P13864 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
Dnmt1P13864 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
Dnmt1P13864 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
Dnmt1P13864 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
Dnmt1P13864 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
Dnmt1P13864 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC33.68■■■□□ 2.98
Dnmt1P13864 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
Dnmt1P13864 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
Dnmt1P13864 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
Dnmt1P13864 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC33.68■■■□□ 2.98
Dnmt1P13864 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
Dnmt1P13864 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
Dnmt1P13864 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
Dnmt1P13864 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
Dnmt1P13864 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
Dnmt1P13864 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC33.64■■■□□ 2.98
Dnmt1P13864 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
Dnmt1P13864 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
Dnmt1P13864 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC33.63■■■□□ 2.97
Dnmt1P13864 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
Dnmt1P13864 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC33.63■■■□□ 2.97
Dnmt1P13864 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
Dnmt1P13864 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
Dnmt1P13864 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
Dnmt1P13864 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
Dnmt1P13864 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.62■■■□□ 2.97
Dnmt1P13864 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
Dnmt1P13864 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
Dnmt1P13864 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC33.61■■■□□ 2.97
Dnmt1P13864 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC33.61■■■□□ 2.97
Dnmt1P13864 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.61■■■□□ 2.97
Dnmt1P13864 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
Dnmt1P13864 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
Dnmt1P13864 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC33.6■■■□□ 2.97
Dnmt1P13864 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
Dnmt1P13864 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
Dnmt1P13864 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
Dnmt1P13864 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC33.59■■■□□ 2.97
Dnmt1P13864 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
Dnmt1P13864 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
Dnmt1P13864 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
Dnmt1P13864 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.58■■■□□ 2.97
Dnmt1P13864 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
Dnmt1P13864 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC33.58■■■□□ 2.97
Dnmt1P13864 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
Dnmt1P13864 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC33.58■■■□□ 2.97
Dnmt1P13864 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC33.57■■■□□ 2.97
Dnmt1P13864 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC33.57■■■□□ 2.97
Dnmt1P13864 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.97
Dnmt1P13864 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC33.57■■■□□ 2.96
Dnmt1P13864 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
Dnmt1P13864 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.57■■■□□ 2.96
Dnmt1P13864 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
Dnmt1P13864 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
Dnmt1P13864 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC33.56■■■□□ 2.96
Dnmt1P13864 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC33.56■■■□□ 2.96
Dnmt1P13864 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.8 ms