Protein–RNA interactions for Protein: P13373

Vpreb2, Immunoglobulin omega chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb2P13373 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Vpreb2P13373 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Vpreb2P13373 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Vpreb2P13373 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Vpreb2P13373 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Vpreb2P13373 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
Vpreb2P13373 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Vpreb2P13373 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Vpreb2P13373 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Vpreb2P13373 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Vpreb2P13373 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Vpreb2P13373 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Vpreb2P13373 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Vpreb2P13373 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Vpreb2P13373 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Vpreb2P13373 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
Vpreb2P13373 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Vpreb2P13373 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Vpreb2P13373 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Vpreb2P13373 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Vpreb2P13373 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Vpreb2P13373 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Vpreb2P13373 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Vpreb2P13373 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Vpreb2P13373 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Vpreb2P13373 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Vpreb2P13373 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Vpreb2P13373 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Vpreb2P13373 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Vpreb2P13373 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Vpreb2P13373 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Vpreb2P13373 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC14□□□□□ -0.17
Vpreb2P13373 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Vpreb2P13373 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Vpreb2P13373 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Vpreb2P13373 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Vpreb2P13373 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Vpreb2P13373 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Vpreb2P13373 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Vpreb2P13373 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Vpreb2P13373 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Vpreb2P13373 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Vpreb2P13373 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Vpreb2P13373 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Vpreb2P13373 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Vpreb2P13373 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Vpreb2P13373 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Vpreb2P13373 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Vpreb2P13373 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Vpreb2P13373 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Vpreb2P13373 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Vpreb2P13373 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Vpreb2P13373 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Vpreb2P13373 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Vpreb2P13373 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Vpreb2P13373 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Vpreb2P13373 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Vpreb2P13373 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Vpreb2P13373 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Vpreb2P13373 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Vpreb2P13373 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Vpreb2P13373 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Vpreb2P13373 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Vpreb2P13373 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Vpreb2P13373 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Vpreb2P13373 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Vpreb2P13373 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Vpreb2P13373 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Vpreb2P13373 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Vpreb2P13373 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Vpreb2P13373 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Vpreb2P13373 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Vpreb2P13373 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Vpreb2P13373 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Vpreb2P13373 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Vpreb2P13373 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Vpreb2P13373 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Vpreb2P13373 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Vpreb2P13373 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Vpreb2P13373 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Vpreb2P13373 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Vpreb2P13373 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Vpreb2P13373 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Vpreb2P13373 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Vpreb2P13373 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Vpreb2P13373 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Vpreb2P13373 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Vpreb2P13373 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Vpreb2P13373 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Vpreb2P13373 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Vpreb2P13373 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Vpreb2P13373 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Vpreb2P13373 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Vpreb2P13373 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Vpreb2P13373 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Vpreb2P13373 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Vpreb2P13373 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Vpreb2P13373 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Vpreb2P13373 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Vpreb2P13373 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.7 ms