Protein–RNA interactions for Protein: P11688

Itga5, Integrin alpha-5, mousemouse

Predictions only

Length 1,053 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga5P11688 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Itga5P11688 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
Itga5P11688 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Itga5P11688 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Itga5P11688 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Itga5P11688 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Itga5P11688 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC19.39■□□□□ 0.7
Itga5P11688 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Itga5P11688 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Itga5P11688 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Itga5P11688 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Itga5P11688 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Itga5P11688 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Itga5P11688 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Itga5P11688 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Itga5P11688 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Itga5P11688 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Itga5P11688 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Itga5P11688 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Itga5P11688 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Itga5P11688 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Itga5P11688 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Itga5P11688 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Itga5P11688 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Itga5P11688 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Itga5P11688 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Itga5P11688 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Itga5P11688 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Itga5P11688 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Itga5P11688 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Itga5P11688 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Itga5P11688 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Itga5P11688 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Itga5P11688 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Itga5P11688 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Itga5P11688 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Itga5P11688 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Itga5P11688 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Itga5P11688 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Itga5P11688 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Itga5P11688 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Itga5P11688 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Itga5P11688 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Itga5P11688 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Itga5P11688 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Itga5P11688 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Itga5P11688 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Itga5P11688 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Itga5P11688 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Itga5P11688 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Itga5P11688 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Itga5P11688 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Itga5P11688 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Itga5P11688 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Itga5P11688 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Itga5P11688 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Itga5P11688 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Itga5P11688 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Itga5P11688 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Itga5P11688 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Itga5P11688 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Itga5P11688 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Itga5P11688 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Itga5P11688 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Itga5P11688 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Itga5P11688 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Itga5P11688 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Itga5P11688 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Itga5P11688 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Itga5P11688 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Itga5P11688 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Itga5P11688 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Itga5P11688 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Itga5P11688 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Itga5P11688 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Itga5P11688 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Itga5P11688 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Itga5P11688 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Itga5P11688 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Itga5P11688 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Itga5P11688 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Itga5P11688 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Itga5P11688 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Itga5P11688 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Itga5P11688 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Itga5P11688 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Itga5P11688 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Itga5P11688 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Itga5P11688 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Itga5P11688 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Itga5P11688 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Itga5P11688 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Itga5P11688 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Itga5P11688 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Itga5P11688 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Itga5P11688 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Itga5P11688 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Itga5P11688 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Itga5P11688 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Itga5P11688 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.9 ms