Protein–RNA interactions for Protein: P11416

Rara, Retinoic acid receptor alpha, mousemouse

Predictions only

Length 462 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RaraP11416 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RaraP11416 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RaraP11416 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RaraP11416 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RaraP11416 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RaraP11416 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
RaraP11416 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RaraP11416 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RaraP11416 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RaraP11416 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RaraP11416 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RaraP11416 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RaraP11416 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RaraP11416 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RaraP11416 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RaraP11416 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RaraP11416 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
RaraP11416 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RaraP11416 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
RaraP11416 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RaraP11416 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RaraP11416 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RaraP11416 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RaraP11416 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RaraP11416 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RaraP11416 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RaraP11416 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RaraP11416 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
RaraP11416 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RaraP11416 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RaraP11416 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RaraP11416 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RaraP11416 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RaraP11416 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RaraP11416 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RaraP11416 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RaraP11416 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RaraP11416 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RaraP11416 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RaraP11416 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RaraP11416 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
RaraP11416 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RaraP11416 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RaraP11416 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RaraP11416 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RaraP11416 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RaraP11416 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RaraP11416 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RaraP11416 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RaraP11416 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RaraP11416 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RaraP11416 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RaraP11416 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RaraP11416 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
RaraP11416 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RaraP11416 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RaraP11416 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RaraP11416 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RaraP11416 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RaraP11416 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RaraP11416 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RaraP11416 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RaraP11416 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RaraP11416 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RaraP11416 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RaraP11416 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RaraP11416 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RaraP11416 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RaraP11416 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RaraP11416 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RaraP11416 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RaraP11416 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RaraP11416 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RaraP11416 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RaraP11416 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RaraP11416 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RaraP11416 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RaraP11416 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RaraP11416 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RaraP11416 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RaraP11416 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RaraP11416 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RaraP11416 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RaraP11416 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RaraP11416 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
RaraP11416 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RaraP11416 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RaraP11416 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RaraP11416 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RaraP11416 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RaraP11416 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RaraP11416 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RaraP11416 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
RaraP11416 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RaraP11416 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RaraP11416 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RaraP11416 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RaraP11416 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RaraP11416 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RaraP11416 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms