Protein–RNA interactions for Protein: P10889

Cxcl2, C-X-C motif chemokine 2, mousemouse

Predictions only

Length 100 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcl2P10889 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cxcl2P10889 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cxcl2P10889 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cxcl2P10889 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cxcl2P10889 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cxcl2P10889 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cxcl2P10889 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cxcl2P10889 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cxcl2P10889 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cxcl2P10889 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cxcl2P10889 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cxcl2P10889 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cxcl2P10889 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cxcl2P10889 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cxcl2P10889 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cxcl2P10889 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cxcl2P10889 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cxcl2P10889 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cxcl2P10889 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cxcl2P10889 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cxcl2P10889 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cxcl2P10889 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cxcl2P10889 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cxcl2P10889 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cxcl2P10889 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cxcl2P10889 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cxcl2P10889 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cxcl2P10889 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Cxcl2P10889 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cxcl2P10889 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cxcl2P10889 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cxcl2P10889 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Cxcl2P10889 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cxcl2P10889 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cxcl2P10889 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Cxcl2P10889 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cxcl2P10889 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cxcl2P10889 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cxcl2P10889 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cxcl2P10889 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cxcl2P10889 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Cxcl2P10889 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cxcl2P10889 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Cxcl2P10889 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cxcl2P10889 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cxcl2P10889 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cxcl2P10889 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cxcl2P10889 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cxcl2P10889 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cxcl2P10889 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cxcl2P10889 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cxcl2P10889 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cxcl2P10889 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cxcl2P10889 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cxcl2P10889 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cxcl2P10889 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cxcl2P10889 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cxcl2P10889 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cxcl2P10889 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cxcl2P10889 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cxcl2P10889 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cxcl2P10889 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cxcl2P10889 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cxcl2P10889 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Cxcl2P10889 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cxcl2P10889 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cxcl2P10889 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cxcl2P10889 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cxcl2P10889 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Cxcl2P10889 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cxcl2P10889 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cxcl2P10889 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Cxcl2P10889 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cxcl2P10889 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cxcl2P10889 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cxcl2P10889 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cxcl2P10889 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cxcl2P10889 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cxcl2P10889 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cxcl2P10889 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cxcl2P10889 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cxcl2P10889 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cxcl2P10889 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cxcl2P10889 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Cxcl2P10889 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cxcl2P10889 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cxcl2P10889 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cxcl2P10889 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cxcl2P10889 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cxcl2P10889 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cxcl2P10889 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cxcl2P10889 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cxcl2P10889 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cxcl2P10889 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cxcl2P10889 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cxcl2P10889 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cxcl2P10889 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cxcl2P10889 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cxcl2P10889 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cxcl2P10889 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.5 ms