Protein–RNA interactions for Protein: P10628

Hoxd4, Homeobox protein Hox-D4, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd4P10628 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Hoxd4P10628 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Hoxd4P10628 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Hoxd4P10628 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Hoxd4P10628 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Hoxd4P10628 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Hoxd4P10628 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Hoxd4P10628 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Hoxd4P10628 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Hoxd4P10628 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Hoxd4P10628 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Hoxd4P10628 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Hoxd4P10628 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Hoxd4P10628 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Hoxd4P10628 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Hoxd4P10628 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Hoxd4P10628 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Hoxd4P10628 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Hoxd4P10628 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Hoxd4P10628 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Hoxd4P10628 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Hoxd4P10628 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Hoxd4P10628 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Hoxd4P10628 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Hoxd4P10628 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Hoxd4P10628 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Hoxd4P10628 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Hoxd4P10628 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Hoxd4P10628 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Hoxd4P10628 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Hoxd4P10628 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Hoxd4P10628 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Hoxd4P10628 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Hoxd4P10628 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Hoxd4P10628 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Hoxd4P10628 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Hoxd4P10628 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Hoxd4P10628 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Hoxd4P10628 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Hoxd4P10628 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Hoxd4P10628 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Hoxd4P10628 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Hoxd4P10628 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Hoxd4P10628 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Hoxd4P10628 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Hoxd4P10628 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Hoxd4P10628 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Hoxd4P10628 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Hoxd4P10628 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Hoxd4P10628 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Hoxd4P10628 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Hoxd4P10628 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Hoxd4P10628 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Hoxd4P10628 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Hoxd4P10628 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Hoxd4P10628 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Hoxd4P10628 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Hoxd4P10628 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Hoxd4P10628 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Hoxd4P10628 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Hoxd4P10628 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Hoxd4P10628 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Hoxd4P10628 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Hoxd4P10628 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Hoxd4P10628 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Hoxd4P10628 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Hoxd4P10628 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Hoxd4P10628 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Hoxd4P10628 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Hoxd4P10628 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Hoxd4P10628 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Hoxd4P10628 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Hoxd4P10628 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Hoxd4P10628 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Hoxd4P10628 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Hoxd4P10628 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Hoxd4P10628 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Hoxd4P10628 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Hoxd4P10628 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Hoxd4P10628 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Hoxd4P10628 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Hoxd4P10628 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Hoxd4P10628 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Hoxd4P10628 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Hoxd4P10628 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Hoxd4P10628 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Hoxd4P10628 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Hoxd4P10628 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Hoxd4P10628 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Hoxd4P10628 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Hoxd4P10628 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Hoxd4P10628 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Hoxd4P10628 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Hoxd4P10628 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Hoxd4P10628 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Hoxd4P10628 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Hoxd4P10628 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Hoxd4P10628 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Hoxd4P10628 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Hoxd4P10628 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms