Protein–RNA interactions for Protein: P10300

Cd8b, T-cell surface glycoprotein CD8 beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd8bP10300 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cd8bP10300 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cd8bP10300 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Cd8bP10300 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cd8bP10300 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Cd8bP10300 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cd8bP10300 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cd8bP10300 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cd8bP10300 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cd8bP10300 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cd8bP10300 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cd8bP10300 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cd8bP10300 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cd8bP10300 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cd8bP10300 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cd8bP10300 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cd8bP10300 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cd8bP10300 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cd8bP10300 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cd8bP10300 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cd8bP10300 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cd8bP10300 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cd8bP10300 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cd8bP10300 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cd8bP10300 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cd8bP10300 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cd8bP10300 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cd8bP10300 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cd8bP10300 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cd8bP10300 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cd8bP10300 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cd8bP10300 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cd8bP10300 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cd8bP10300 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cd8bP10300 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cd8bP10300 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cd8bP10300 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cd8bP10300 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cd8bP10300 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cd8bP10300 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cd8bP10300 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cd8bP10300 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cd8bP10300 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cd8bP10300 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cd8bP10300 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cd8bP10300 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cd8bP10300 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Cd8bP10300 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cd8bP10300 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cd8bP10300 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cd8bP10300 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cd8bP10300 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cd8bP10300 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cd8bP10300 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cd8bP10300 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cd8bP10300 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cd8bP10300 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cd8bP10300 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cd8bP10300 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cd8bP10300 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cd8bP10300 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cd8bP10300 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cd8bP10300 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cd8bP10300 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cd8bP10300 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cd8bP10300 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Cd8bP10300 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cd8bP10300 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cd8bP10300 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cd8bP10300 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cd8bP10300 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cd8bP10300 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cd8bP10300 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cd8bP10300 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cd8bP10300 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cd8bP10300 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cd8bP10300 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cd8bP10300 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cd8bP10300 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Cd8bP10300 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cd8bP10300 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cd8bP10300 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cd8bP10300 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cd8bP10300 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cd8bP10300 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Cd8bP10300 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cd8bP10300 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cd8bP10300 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cd8bP10300 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cd8bP10300 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cd8bP10300 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cd8bP10300 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cd8bP10300 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cd8bP10300 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cd8bP10300 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cd8bP10300 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cd8bP10300 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cd8bP10300 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cd8bP10300 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cd8bP10300 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.5 ms