Protein–RNA interactions for Protein: P0C1T1

Hoxb2, Homeobox protein Hox-B2, mousemouse

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Length 354 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb2P0C1T1 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Hoxb2P0C1T1 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Hoxb2P0C1T1 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Hoxb2P0C1T1 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Hoxb2P0C1T1 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Hoxb2P0C1T1 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Hoxb2P0C1T1 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Hoxb2P0C1T1 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Hoxb2P0C1T1 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Hoxb2P0C1T1 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Hoxb2P0C1T1 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Hoxb2P0C1T1 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Hoxb2P0C1T1 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Hoxb2P0C1T1 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Hoxb2P0C1T1 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Hoxb2P0C1T1 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Hoxb2P0C1T1 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Hoxb2P0C1T1 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Hoxb2P0C1T1 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Hoxb2P0C1T1 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Hoxb2P0C1T1 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Hoxb2P0C1T1 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Hoxb2P0C1T1 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Hoxb2P0C1T1 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Hoxb2P0C1T1 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Hoxb2P0C1T1 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Hoxb2P0C1T1 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Hoxb2P0C1T1 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Hoxb2P0C1T1 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Hoxb2P0C1T1 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Hoxb2P0C1T1 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Hoxb2P0C1T1 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Hoxb2P0C1T1 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Hoxb2P0C1T1 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Hoxb2P0C1T1 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Hoxb2P0C1T1 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Hoxb2P0C1T1 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Hoxb2P0C1T1 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Hoxb2P0C1T1 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Hoxb2P0C1T1 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Hoxb2P0C1T1 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Hoxb2P0C1T1 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Hoxb2P0C1T1 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Hoxb2P0C1T1 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Hoxb2P0C1T1 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Hoxb2P0C1T1 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Hoxb2P0C1T1 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Hoxb2P0C1T1 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Hoxb2P0C1T1 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Hoxb2P0C1T1 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Hoxb2P0C1T1 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Hoxb2P0C1T1 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Hoxb2P0C1T1 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Hoxb2P0C1T1 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Hoxb2P0C1T1 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Hoxb2P0C1T1 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Hoxb2P0C1T1 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Hoxb2P0C1T1 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Hoxb2P0C1T1 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Hoxb2P0C1T1 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Hoxb2P0C1T1 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Hoxb2P0C1T1 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hoxb2P0C1T1 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hoxb2P0C1T1 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hoxb2P0C1T1 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hoxb2P0C1T1 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hoxb2P0C1T1 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hoxb2P0C1T1 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hoxb2P0C1T1 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hoxb2P0C1T1 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hoxb2P0C1T1 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hoxb2P0C1T1 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hoxb2P0C1T1 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hoxb2P0C1T1 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hoxb2P0C1T1 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hoxb2P0C1T1 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hoxb2P0C1T1 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hoxb2P0C1T1 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hoxb2P0C1T1 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hoxb2P0C1T1 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Hoxb2P0C1T1 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hoxb2P0C1T1 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hoxb2P0C1T1 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hoxb2P0C1T1 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hoxb2P0C1T1 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hoxb2P0C1T1 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hoxb2P0C1T1 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hoxb2P0C1T1 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hoxb2P0C1T1 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hoxb2P0C1T1 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hoxb2P0C1T1 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hoxb2P0C1T1 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hoxb2P0C1T1 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hoxb2P0C1T1 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Hoxb2P0C1T1 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hoxb2P0C1T1 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hoxb2P0C1T1 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hoxb2P0C1T1 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hoxb2P0C1T1 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hoxb2P0C1T1 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
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