Protein–RNA interactions for Protein: P09920

Csf3, Granulocyte colony-stimulating factor, mousemouse

Predictions only

Length 208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csf3P09920 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Csf3P09920 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Csf3P09920 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Csf3P09920 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Csf3P09920 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Csf3P09920 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Csf3P09920 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Csf3P09920 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Csf3P09920 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Csf3P09920 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Csf3P09920 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Csf3P09920 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Csf3P09920 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Csf3P09920 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Csf3P09920 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Csf3P09920 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Csf3P09920 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Csf3P09920 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Csf3P09920 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Csf3P09920 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Csf3P09920 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Csf3P09920 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Csf3P09920 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Csf3P09920 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Csf3P09920 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Csf3P09920 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Csf3P09920 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Csf3P09920 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Csf3P09920 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Csf3P09920 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Csf3P09920 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Csf3P09920 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Csf3P09920 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Csf3P09920 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Csf3P09920 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Csf3P09920 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Csf3P09920 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Csf3P09920 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Csf3P09920 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Csf3P09920 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Csf3P09920 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Csf3P09920 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Csf3P09920 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Csf3P09920 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Csf3P09920 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Csf3P09920 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Csf3P09920 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Csf3P09920 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Csf3P09920 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Csf3P09920 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Csf3P09920 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Csf3P09920 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Csf3P09920 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Csf3P09920 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Csf3P09920 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Csf3P09920 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Csf3P09920 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Csf3P09920 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Csf3P09920 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Csf3P09920 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Csf3P09920 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Csf3P09920 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Csf3P09920 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Csf3P09920 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Csf3P09920 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Csf3P09920 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Csf3P09920 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Csf3P09920 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Csf3P09920 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Csf3P09920 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Csf3P09920 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Csf3P09920 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Csf3P09920 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Csf3P09920 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Csf3P09920 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Csf3P09920 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Csf3P09920 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Csf3P09920 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Csf3P09920 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Csf3P09920 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Csf3P09920 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Csf3P09920 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Csf3P09920 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Csf3P09920 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Csf3P09920 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Csf3P09920 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Csf3P09920 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Csf3P09920 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Csf3P09920 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Csf3P09920 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Csf3P09920 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Csf3P09920 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Csf3P09920 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Csf3P09920 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Csf3P09920 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Csf3P09920 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Csf3P09920 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Csf3P09920 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Csf3P09920 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Csf3P09920 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms