Protein–RNA interactions for Protein: P06321

T-cell receptor beta chain V region A20.2.25, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P06321 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
P06321 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
P06321 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
P06321 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
P06321 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
P06321 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
P06321 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
P06321 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
P06321 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
P06321 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
P06321 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
P06321 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
P06321 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
P06321 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
P06321 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
P06321 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
P06321 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
P06321 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
P06321 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
P06321 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
P06321 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
P06321 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
P06321 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
P06321 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
P06321 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
P06321 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
P06321 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
P06321 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
P06321 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
P06321 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
P06321 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
P06321 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
P06321 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
P06321 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
P06321 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
P06321 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
P06321 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
P06321 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
P06321 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
P06321 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
P06321 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
P06321 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
P06321 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
P06321 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
P06321 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
P06321 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
P06321 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
P06321 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
P06321 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
P06321 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
P06321 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
P06321 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
P06321 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
P06321 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
P06321 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
P06321 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
P06321 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
P06321 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
P06321 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
P06321 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
P06321 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
P06321 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
P06321 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
P06321 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
P06321 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
P06321 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
P06321 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
P06321 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
P06321 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
P06321 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
P06321 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
P06321 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
P06321 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
P06321 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
P06321 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
P06321 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
P06321 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
P06321 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
P06321 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
P06321 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
P06321 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
P06321 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
P06321 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
P06321 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
P06321 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
P06321 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
P06321 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
P06321 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
P06321 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
P06321 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
P06321 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
P06321 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
P06321 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
P06321 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
P06321 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
P06321 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
P06321 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
P06321 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
P06321 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
P06321 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.7 ms