Protein–RNA interactions for Protein: P05622

Pdgfrb, Platelet-derived growth factor receptor beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,098 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfrbP05622 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PdgfrbP05622 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PdgfrbP05622 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PdgfrbP05622 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PdgfrbP05622 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PdgfrbP05622 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PdgfrbP05622 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PdgfrbP05622 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PdgfrbP05622 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PdgfrbP05622 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PdgfrbP05622 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PdgfrbP05622 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PdgfrbP05622 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PdgfrbP05622 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PdgfrbP05622 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PdgfrbP05622 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PdgfrbP05622 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PdgfrbP05622 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
PdgfrbP05622 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PdgfrbP05622 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PdgfrbP05622 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PdgfrbP05622 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PdgfrbP05622 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PdgfrbP05622 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PdgfrbP05622 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PdgfrbP05622 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PdgfrbP05622 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PdgfrbP05622 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PdgfrbP05622 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
PdgfrbP05622 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
PdgfrbP05622 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PdgfrbP05622 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PdgfrbP05622 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PdgfrbP05622 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PdgfrbP05622 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PdgfrbP05622 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PdgfrbP05622 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PdgfrbP05622 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PdgfrbP05622 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PdgfrbP05622 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PdgfrbP05622 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PdgfrbP05622 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PdgfrbP05622 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PdgfrbP05622 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PdgfrbP05622 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PdgfrbP05622 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PdgfrbP05622 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PdgfrbP05622 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PdgfrbP05622 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PdgfrbP05622 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PdgfrbP05622 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PdgfrbP05622 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PdgfrbP05622 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PdgfrbP05622 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PdgfrbP05622 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PdgfrbP05622 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PdgfrbP05622 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PdgfrbP05622 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PdgfrbP05622 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PdgfrbP05622 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PdgfrbP05622 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PdgfrbP05622 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PdgfrbP05622 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PdgfrbP05622 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PdgfrbP05622 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PdgfrbP05622 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PdgfrbP05622 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PdgfrbP05622 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PdgfrbP05622 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PdgfrbP05622 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PdgfrbP05622 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PdgfrbP05622 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PdgfrbP05622 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PdgfrbP05622 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PdgfrbP05622 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PdgfrbP05622 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PdgfrbP05622 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PdgfrbP05622 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PdgfrbP05622 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
PdgfrbP05622 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PdgfrbP05622 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PdgfrbP05622 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
PdgfrbP05622 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
PdgfrbP05622 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PdgfrbP05622 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PdgfrbP05622 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PdgfrbP05622 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PdgfrbP05622 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PdgfrbP05622 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PdgfrbP05622 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PdgfrbP05622 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PdgfrbP05622 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PdgfrbP05622 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PdgfrbP05622 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PdgfrbP05622 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PdgfrbP05622 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PdgfrbP05622 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PdgfrbP05622 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PdgfrbP05622 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PdgfrbP05622 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms