Protein–RNA interactions for Protein: P04756

Chrna1, Acetylcholine receptor subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chrna1P04756 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Chrna1P04756 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Chrna1P04756 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Chrna1P04756 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Chrna1P04756 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Chrna1P04756 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Chrna1P04756 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Chrna1P04756 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Chrna1P04756 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Chrna1P04756 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Chrna1P04756 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Chrna1P04756 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Chrna1P04756 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Chrna1P04756 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Chrna1P04756 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Chrna1P04756 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Chrna1P04756 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Chrna1P04756 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Chrna1P04756 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Chrna1P04756 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Chrna1P04756 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Chrna1P04756 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Chrna1P04756 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Chrna1P04756 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Chrna1P04756 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Chrna1P04756 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Chrna1P04756 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Chrna1P04756 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Chrna1P04756 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Chrna1P04756 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Chrna1P04756 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Chrna1P04756 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Chrna1P04756 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Chrna1P04756 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Chrna1P04756 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Chrna1P04756 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Chrna1P04756 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Chrna1P04756 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Chrna1P04756 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Chrna1P04756 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Chrna1P04756 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Chrna1P04756 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Chrna1P04756 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Chrna1P04756 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Chrna1P04756 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Chrna1P04756 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Chrna1P04756 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Chrna1P04756 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Chrna1P04756 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Chrna1P04756 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Chrna1P04756 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Chrna1P04756 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Chrna1P04756 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Chrna1P04756 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Chrna1P04756 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Chrna1P04756 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Chrna1P04756 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Chrna1P04756 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Chrna1P04756 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Chrna1P04756 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Chrna1P04756 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Chrna1P04756 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Chrna1P04756 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Chrna1P04756 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Chrna1P04756 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Chrna1P04756 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Chrna1P04756 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Chrna1P04756 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Chrna1P04756 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Chrna1P04756 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Chrna1P04756 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Chrna1P04756 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Chrna1P04756 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Chrna1P04756 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Chrna1P04756 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Chrna1P04756 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Chrna1P04756 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Chrna1P04756 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Chrna1P04756 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Chrna1P04756 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Chrna1P04756 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Chrna1P04756 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Chrna1P04756 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Chrna1P04756 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Chrna1P04756 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Chrna1P04756 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Chrna1P04756 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Chrna1P04756 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Chrna1P04756 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Chrna1P04756 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Chrna1P04756 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Chrna1P04756 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Chrna1P04756 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Chrna1P04756 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Chrna1P04756 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Chrna1P04756 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Chrna1P04756 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Chrna1P04756 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Chrna1P04756 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Chrna1P04756 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms