Protein–RNA interactions for Protein: P04212

T-cell receptor beta chain V region LB2, mousemouse

Predictions only

Length 136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P04212 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
P04212 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
P04212 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
P04212 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
P04212 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
P04212 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
P04212 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
P04212 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
P04212 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
P04212 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
P04212 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
P04212 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
P04212 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
P04212 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
P04212 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
P04212 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
P04212 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
P04212 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
P04212 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
P04212 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
P04212 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
P04212 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
P04212 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
P04212 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
P04212 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
P04212 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
P04212 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
P04212 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
P04212 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
P04212 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
P04212 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
P04212 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
P04212 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
P04212 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
P04212 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
P04212 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
P04212 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
P04212 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
P04212 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
P04212 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
P04212 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
P04212 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
P04212 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
P04212 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
P04212 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
P04212 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
P04212 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
P04212 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
P04212 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
P04212 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
P04212 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
P04212 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
P04212 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
P04212 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
P04212 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
P04212 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
P04212 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
P04212 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
P04212 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
P04212 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
P04212 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
P04212 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
P04212 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
P04212 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
P04212 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
P04212 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
P04212 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
P04212 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
P04212 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
P04212 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
P04212 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
P04212 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
P04212 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
P04212 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
P04212 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
P04212 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
P04212 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
P04212 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
P04212 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
P04212 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
P04212 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
P04212 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
P04212 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
P04212 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
P04212 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
P04212 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
P04212 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
P04212 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
P04212 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
P04212 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
P04212 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
P04212 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
P04212 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
P04212 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
P04212 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
P04212 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
P04212 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
P04212 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
P04212 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
P04212 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms