Protein–RNA interactions for Protein: P04187

Gzmb, Granzyme B(G,H), mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GzmbP04187 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GzmbP04187 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GzmbP04187 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GzmbP04187 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GzmbP04187 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
GzmbP04187 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GzmbP04187 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GzmbP04187 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GzmbP04187 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GzmbP04187 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
GzmbP04187 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
GzmbP04187 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
GzmbP04187 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GzmbP04187 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GzmbP04187 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GzmbP04187 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GzmbP04187 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GzmbP04187 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GzmbP04187 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GzmbP04187 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GzmbP04187 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GzmbP04187 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GzmbP04187 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
GzmbP04187 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GzmbP04187 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
GzmbP04187 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GzmbP04187 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GzmbP04187 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GzmbP04187 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GzmbP04187 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GzmbP04187 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GzmbP04187 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GzmbP04187 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GzmbP04187 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GzmbP04187 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
GzmbP04187 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GzmbP04187 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GzmbP04187 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GzmbP04187 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GzmbP04187 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GzmbP04187 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GzmbP04187 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GzmbP04187 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
GzmbP04187 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GzmbP04187 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GzmbP04187 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GzmbP04187 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GzmbP04187 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GzmbP04187 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GzmbP04187 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GzmbP04187 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GzmbP04187 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GzmbP04187 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GzmbP04187 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GzmbP04187 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GzmbP04187 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GzmbP04187 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
GzmbP04187 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GzmbP04187 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GzmbP04187 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GzmbP04187 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
GzmbP04187 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GzmbP04187 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GzmbP04187 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GzmbP04187 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GzmbP04187 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GzmbP04187 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GzmbP04187 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GzmbP04187 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GzmbP04187 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GzmbP04187 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
GzmbP04187 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
GzmbP04187 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GzmbP04187 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GzmbP04187 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GzmbP04187 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GzmbP04187 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
GzmbP04187 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GzmbP04187 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GzmbP04187 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GzmbP04187 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
GzmbP04187 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
GzmbP04187 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
GzmbP04187 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
GzmbP04187 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
GzmbP04187 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
GzmbP04187 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
GzmbP04187 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
GzmbP04187 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
GzmbP04187 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
GzmbP04187 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
GzmbP04187 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
GzmbP04187 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
GzmbP04187 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
GzmbP04187 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
GzmbP04187 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
GzmbP04187 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
GzmbP04187 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
GzmbP04187 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
GzmbP04187 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms