Protein–RNA interactions for Protein: P01901

H2-K1, H-2 class I histocompatibility antigen, K-B alpha chain, mousemouse

Predictions only

Length 369 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-K1P01901 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
H2-K1P01901 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
H2-K1P01901 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
H2-K1P01901 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
H2-K1P01901 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
H2-K1P01901 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
H2-K1P01901 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
H2-K1P01901 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
H2-K1P01901 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
H2-K1P01901 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
H2-K1P01901 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
H2-K1P01901 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
H2-K1P01901 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
H2-K1P01901 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
H2-K1P01901 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
H2-K1P01901 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
H2-K1P01901 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
H2-K1P01901 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
H2-K1P01901 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
H2-K1P01901 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
H2-K1P01901 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
H2-K1P01901 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
H2-K1P01901 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
H2-K1P01901 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
H2-K1P01901 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
H2-K1P01901 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
H2-K1P01901 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
H2-K1P01901 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
H2-K1P01901 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
H2-K1P01901 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
H2-K1P01901 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
H2-K1P01901 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
H2-K1P01901 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
H2-K1P01901 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
H2-K1P01901 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
H2-K1P01901 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
H2-K1P01901 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
H2-K1P01901 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
H2-K1P01901 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
H2-K1P01901 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
H2-K1P01901 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
H2-K1P01901 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
H2-K1P01901 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
H2-K1P01901 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
H2-K1P01901 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
H2-K1P01901 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
H2-K1P01901 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
H2-K1P01901 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
H2-K1P01901 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
H2-K1P01901 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
H2-K1P01901 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
H2-K1P01901 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
H2-K1P01901 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
H2-K1P01901 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
H2-K1P01901 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
H2-K1P01901 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
H2-K1P01901 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
H2-K1P01901 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
H2-K1P01901 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
H2-K1P01901 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
H2-K1P01901 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
H2-K1P01901 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
H2-K1P01901 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
H2-K1P01901 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
H2-K1P01901 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
H2-K1P01901 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
H2-K1P01901 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
H2-K1P01901 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
H2-K1P01901 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
H2-K1P01901 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
H2-K1P01901 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
H2-K1P01901 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
H2-K1P01901 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
H2-K1P01901 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
H2-K1P01901 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
H2-K1P01901 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
H2-K1P01901 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
H2-K1P01901 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
H2-K1P01901 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
H2-K1P01901 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
H2-K1P01901 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
H2-K1P01901 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
H2-K1P01901 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
H2-K1P01901 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
H2-K1P01901 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
H2-K1P01901 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
H2-K1P01901 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
H2-K1P01901 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
H2-K1P01901 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
H2-K1P01901 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
H2-K1P01901 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
H2-K1P01901 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
H2-K1P01901 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
H2-K1P01901 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
H2-K1P01901 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
H2-K1P01901 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
H2-K1P01901 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
H2-K1P01901 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
H2-K1P01901 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
H2-K1P01901 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms