Protein–RNA interactions for Protein: P01747

Ig heavy chain V region 36-65, mousemouse

Predictions only

Length 120 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01747 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P01747 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P01747 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P01747 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
P01747 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P01747 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P01747 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P01747 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P01747 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
P01747 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P01747 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P01747 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P01747 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P01747 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P01747 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01747 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01747 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01747 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01747 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01747 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01747 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01747 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01747 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01747 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01747 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01747 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01747 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01747 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01747 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
P01747 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01747 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01747 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01747 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
P01747 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01747 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01747 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01747 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01747 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01747 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01747 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01747 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01747 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01747 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
P01747 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01747 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01747 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01747 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01747 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01747 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
P01747 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
P01747 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
P01747 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01747 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01747 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01747 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01747 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01747 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01747 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
P01747 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01747 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01747 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01747 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01747 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01747 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01747 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01747 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01747 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01747 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01747 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01747 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01747 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01747 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01747 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01747 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01747 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01747 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01747 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01747 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01747 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01747 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01747 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01747 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01747 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01747 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01747 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01747 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01747 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01747 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01747 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01747 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01747 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01747 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01747 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01747 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01747 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01747 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01747 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01747 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01747 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01747 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms