Protein–RNA interactions for Protein: P01641

Ig kappa chain V-V region MOPC 173B, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01641 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
P01641 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
P01641 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
P01641 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
P01641 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
P01641 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
P01641 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
P01641 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
P01641 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
P01641 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
P01641 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
P01641 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
P01641 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
P01641 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
P01641 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
P01641 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
P01641 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
P01641 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
P01641 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
P01641 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
P01641 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
P01641 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
P01641 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
P01641 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
P01641 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
P01641 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
P01641 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
P01641 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
P01641 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
P01641 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
P01641 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
P01641 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
P01641 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
P01641 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
P01641 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
P01641 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
P01641 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
P01641 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
P01641 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
P01641 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
P01641 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
P01641 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
P01641 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
P01641 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
P01641 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
P01641 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
P01641 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
P01641 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
P01641 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
P01641 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
P01641 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
P01641 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
P01641 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
P01641 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
P01641 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
P01641 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
P01641 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
P01641 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
P01641 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
P01641 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
P01641 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
P01641 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
P01641 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
P01641 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
P01641 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
P01641 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
P01641 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
P01641 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
P01641 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
P01641 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
P01641 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
P01641 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
P01641 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
P01641 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
P01641 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
P01641 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
P01641 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
P01641 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
P01641 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
P01641 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
P01641 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
P01641 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
P01641 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
P01641 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
P01641 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
P01641 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
P01641 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
P01641 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
P01641 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
P01641 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
P01641 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
P01641 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
P01641 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
P01641 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
P01641 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
P01641 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
P01641 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
P01641 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
P01641 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
P01641 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 84.1 ms