Protein–RNA interactions for Protein: P01575

Ifnb1, Interferon beta, mousemouse

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifnb1P01575 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ifnb1P01575 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Ifnb1P01575 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ifnb1P01575 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ifnb1P01575 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ifnb1P01575 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Ifnb1P01575 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ifnb1P01575 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ifnb1P01575 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ifnb1P01575 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ifnb1P01575 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ifnb1P01575 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ifnb1P01575 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ifnb1P01575 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ifnb1P01575 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ifnb1P01575 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ifnb1P01575 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ifnb1P01575 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ifnb1P01575 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ifnb1P01575 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Ifnb1P01575 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ifnb1P01575 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ifnb1P01575 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ifnb1P01575 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ifnb1P01575 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ifnb1P01575 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ifnb1P01575 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ifnb1P01575 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ifnb1P01575 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ifnb1P01575 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ifnb1P01575 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ifnb1P01575 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ifnb1P01575 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ifnb1P01575 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ifnb1P01575 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ifnb1P01575 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ifnb1P01575 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ifnb1P01575 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ifnb1P01575 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Ifnb1P01575 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ifnb1P01575 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ifnb1P01575 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ifnb1P01575 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ifnb1P01575 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ifnb1P01575 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ifnb1P01575 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ifnb1P01575 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Ifnb1P01575 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ifnb1P01575 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ifnb1P01575 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ifnb1P01575 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ifnb1P01575 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ifnb1P01575 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ifnb1P01575 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ifnb1P01575 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ifnb1P01575 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ifnb1P01575 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ifnb1P01575 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ifnb1P01575 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Ifnb1P01575 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
Ifnb1P01575 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ifnb1P01575 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ifnb1P01575 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ifnb1P01575 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ifnb1P01575 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ifnb1P01575 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ifnb1P01575 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ifnb1P01575 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ifnb1P01575 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ifnb1P01575 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ifnb1P01575 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ifnb1P01575 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ifnb1P01575 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ifnb1P01575 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ifnb1P01575 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ifnb1P01575 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ifnb1P01575 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ifnb1P01575 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ifnb1P01575 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ifnb1P01575 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ifnb1P01575 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ifnb1P01575 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ifnb1P01575 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ifnb1P01575 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ifnb1P01575 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ifnb1P01575 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ifnb1P01575 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ifnb1P01575 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ifnb1P01575 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ifnb1P01575 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ifnb1P01575 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ifnb1P01575 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ifnb1P01575 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ifnb1P01575 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ifnb1P01575 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ifnb1P01575 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ifnb1P01575 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ifnb1P01575 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ifnb1P01575 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ifnb1P01575 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms