Protein–RNA interactions for Protein: O88907

Pias1, E3 SUMO-protein ligase PIAS1, mousemouse

Predictions only

Length 651 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pias1O88907 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pias1O88907 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pias1O88907 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pias1O88907 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pias1O88907 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pias1O88907 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Pias1O88907 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pias1O88907 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pias1O88907 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pias1O88907 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Pias1O88907 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Pias1O88907 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pias1O88907 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pias1O88907 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pias1O88907 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Pias1O88907 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pias1O88907 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pias1O88907 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pias1O88907 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pias1O88907 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pias1O88907 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pias1O88907 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pias1O88907 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pias1O88907 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pias1O88907 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pias1O88907 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pias1O88907 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pias1O88907 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pias1O88907 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pias1O88907 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pias1O88907 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pias1O88907 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pias1O88907 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pias1O88907 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pias1O88907 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pias1O88907 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pias1O88907 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pias1O88907 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pias1O88907 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pias1O88907 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pias1O88907 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pias1O88907 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pias1O88907 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pias1O88907 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pias1O88907 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pias1O88907 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Pias1O88907 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Pias1O88907 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Pias1O88907 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Pias1O88907 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Pias1O88907 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Pias1O88907 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Pias1O88907 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Pias1O88907 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pias1O88907 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pias1O88907 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pias1O88907 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pias1O88907 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pias1O88907 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pias1O88907 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pias1O88907 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pias1O88907 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pias1O88907 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pias1O88907 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pias1O88907 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pias1O88907 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Pias1O88907 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pias1O88907 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pias1O88907 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pias1O88907 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pias1O88907 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pias1O88907 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pias1O88907 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pias1O88907 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pias1O88907 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pias1O88907 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pias1O88907 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pias1O88907 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pias1O88907 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pias1O88907 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pias1O88907 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pias1O88907 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pias1O88907 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pias1O88907 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pias1O88907 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pias1O88907 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pias1O88907 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pias1O88907 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Pias1O88907 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Pias1O88907 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Pias1O88907 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Pias1O88907 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Pias1O88907 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Pias1O88907 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Pias1O88907 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Pias1O88907 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Pias1O88907 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Pias1O88907 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Pias1O88907 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Pias1O88907 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.5 ms