Protein–RNA interactions for Protein: O88879

Apaf1, Apoptotic protease-activating factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,249 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apaf1O88879 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Apaf1O88879 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Apaf1O88879 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Apaf1O88879 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Apaf1O88879 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Apaf1O88879 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Apaf1O88879 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Apaf1O88879 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
Apaf1O88879 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Apaf1O88879 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Apaf1O88879 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Apaf1O88879 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Apaf1O88879 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Apaf1O88879 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Apaf1O88879 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Apaf1O88879 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Apaf1O88879 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
Apaf1O88879 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Apaf1O88879 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Apaf1O88879 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Apaf1O88879 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Apaf1O88879 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Apaf1O88879 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Apaf1O88879 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Apaf1O88879 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Apaf1O88879 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Apaf1O88879 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Apaf1O88879 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Apaf1O88879 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Apaf1O88879 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Apaf1O88879 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Apaf1O88879 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Apaf1O88879 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
Apaf1O88879 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Apaf1O88879 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Apaf1O88879 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Apaf1O88879 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Apaf1O88879 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Apaf1O88879 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Apaf1O88879 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Apaf1O88879 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Apaf1O88879 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Apaf1O88879 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Apaf1O88879 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Apaf1O88879 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
Apaf1O88879 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Apaf1O88879 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Apaf1O88879 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Apaf1O88879 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
Apaf1O88879 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Apaf1O88879 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Apaf1O88879 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Apaf1O88879 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Apaf1O88879 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Apaf1O88879 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Apaf1O88879 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Apaf1O88879 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Apaf1O88879 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Apaf1O88879 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Apaf1O88879 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Apaf1O88879 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Apaf1O88879 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Apaf1O88879 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Apaf1O88879 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Apaf1O88879 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Apaf1O88879 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Apaf1O88879 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Apaf1O88879 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Apaf1O88879 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Apaf1O88879 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Apaf1O88879 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Apaf1O88879 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Apaf1O88879 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Apaf1O88879 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Apaf1O88879 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Apaf1O88879 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Apaf1O88879 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Apaf1O88879 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Apaf1O88879 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Apaf1O88879 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Apaf1O88879 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Apaf1O88879 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Apaf1O88879 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Apaf1O88879 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Apaf1O88879 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Apaf1O88879 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Apaf1O88879 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Apaf1O88879 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Apaf1O88879 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Apaf1O88879 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Apaf1O88879 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Apaf1O88879 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
Apaf1O88879 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Apaf1O88879 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
Apaf1O88879 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Apaf1O88879 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Apaf1O88879 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Apaf1O88879 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Apaf1O88879 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
Apaf1O88879 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms