Protein–RNA interactions for Protein: O88879

Apaf1, Apoptotic protease-activating factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apaf1O88879 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Apaf1O88879 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Apaf1O88879 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Apaf1O88879 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Apaf1O88879 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Apaf1O88879 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Apaf1O88879 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Apaf1O88879 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
Apaf1O88879 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Apaf1O88879 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Apaf1O88879 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Apaf1O88879 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Apaf1O88879 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Apaf1O88879 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Apaf1O88879 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Apaf1O88879 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Apaf1O88879 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
Apaf1O88879 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Apaf1O88879 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Apaf1O88879 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Apaf1O88879 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Apaf1O88879 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Apaf1O88879 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Apaf1O88879 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Apaf1O88879 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Apaf1O88879 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Apaf1O88879 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Apaf1O88879 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Apaf1O88879 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Apaf1O88879 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Apaf1O88879 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Apaf1O88879 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Apaf1O88879 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
Apaf1O88879 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Apaf1O88879 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Apaf1O88879 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Apaf1O88879 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Apaf1O88879 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Apaf1O88879 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Apaf1O88879 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Apaf1O88879 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Apaf1O88879 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Apaf1O88879 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Apaf1O88879 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Apaf1O88879 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
Apaf1O88879 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Apaf1O88879 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Apaf1O88879 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Apaf1O88879 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
Apaf1O88879 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Apaf1O88879 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Apaf1O88879 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Apaf1O88879 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Apaf1O88879 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Apaf1O88879 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Apaf1O88879 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Apaf1O88879 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Apaf1O88879 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Apaf1O88879 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Apaf1O88879 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Apaf1O88879 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Apaf1O88879 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Apaf1O88879 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Apaf1O88879 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Apaf1O88879 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Apaf1O88879 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Apaf1O88879 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Apaf1O88879 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Apaf1O88879 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Apaf1O88879 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Apaf1O88879 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Apaf1O88879 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Apaf1O88879 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Apaf1O88879 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Apaf1O88879 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Apaf1O88879 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Apaf1O88879 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Apaf1O88879 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Apaf1O88879 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Apaf1O88879 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Apaf1O88879 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Apaf1O88879 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Apaf1O88879 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Apaf1O88879 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Apaf1O88879 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Apaf1O88879 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Apaf1O88879 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Apaf1O88879 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Apaf1O88879 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Apaf1O88879 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Apaf1O88879 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Apaf1O88879 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
Apaf1O88879 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Apaf1O88879 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
Apaf1O88879 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Apaf1O88879 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Apaf1O88879 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Apaf1O88879 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Apaf1O88879 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
Apaf1O88879 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8 ms