Protein–RNA interactions for Protein: O88703

Hcn2, Potassium/sodium hyperpolarization-activated cyclic nucleotide-gated channel 2, mousemouse

Predictions only

Length 863 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hcn2O88703 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Hcn2O88703 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Hcn2O88703 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Hcn2O88703 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Hcn2O88703 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Hcn2O88703 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Hcn2O88703 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Hcn2O88703 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Hcn2O88703 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Hcn2O88703 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Hcn2O88703 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Hcn2O88703 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Hcn2O88703 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Hcn2O88703 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Hcn2O88703 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Hcn2O88703 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Hcn2O88703 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Hcn2O88703 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Hcn2O88703 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Hcn2O88703 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Hcn2O88703 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Hcn2O88703 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Hcn2O88703 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Hcn2O88703 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Hcn2O88703 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Hcn2O88703 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Hcn2O88703 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Hcn2O88703 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Hcn2O88703 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Hcn2O88703 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Hcn2O88703 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Hcn2O88703 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Hcn2O88703 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Hcn2O88703 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Hcn2O88703 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Hcn2O88703 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Hcn2O88703 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Hcn2O88703 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Hcn2O88703 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Hcn2O88703 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Hcn2O88703 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Hcn2O88703 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Hcn2O88703 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Hcn2O88703 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Hcn2O88703 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Hcn2O88703 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Hcn2O88703 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Hcn2O88703 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Hcn2O88703 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Hcn2O88703 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Hcn2O88703 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Hcn2O88703 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
Hcn2O88703 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Hcn2O88703 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Hcn2O88703 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Hcn2O88703 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Hcn2O88703 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Hcn2O88703 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Hcn2O88703 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Hcn2O88703 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Hcn2O88703 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Hcn2O88703 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Hcn2O88703 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Hcn2O88703 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Hcn2O88703 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Hcn2O88703 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Hcn2O88703 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Hcn2O88703 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Hcn2O88703 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Hcn2O88703 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Hcn2O88703 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Hcn2O88703 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Hcn2O88703 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Hcn2O88703 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Hcn2O88703 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Hcn2O88703 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Hcn2O88703 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Hcn2O88703 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Hcn2O88703 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Hcn2O88703 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Hcn2O88703 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Hcn2O88703 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Hcn2O88703 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Hcn2O88703 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Hcn2O88703 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Hcn2O88703 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Hcn2O88703 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Hcn2O88703 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Hcn2O88703 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Hcn2O88703 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Hcn2O88703 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Hcn2O88703 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Hcn2O88703 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Hcn2O88703 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Hcn2O88703 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Hcn2O88703 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Hcn2O88703 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Hcn2O88703 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Hcn2O88703 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Hcn2O88703 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms