Protein–RNA interactions for Protein: O88384

Vti1b, Vesicle transport through interaction with t-SNAREs homolog 1B, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vti1bO88384 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Vti1bO88384 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Vti1bO88384 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Vti1bO88384 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Vti1bO88384 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Vti1bO88384 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Vti1bO88384 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Vti1bO88384 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Vti1bO88384 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Vti1bO88384 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Vti1bO88384 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Vti1bO88384 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Vti1bO88384 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Vti1bO88384 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Vti1bO88384 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Vti1bO88384 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Vti1bO88384 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Vti1bO88384 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Vti1bO88384 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Vti1bO88384 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Vti1bO88384 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Vti1bO88384 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Vti1bO88384 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Vti1bO88384 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Vti1bO88384 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Vti1bO88384 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Vti1bO88384 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Vti1bO88384 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Vti1bO88384 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Vti1bO88384 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Vti1bO88384 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Vti1bO88384 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Vti1bO88384 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Vti1bO88384 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Vti1bO88384 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Vti1bO88384 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Vti1bO88384 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Vti1bO88384 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Vti1bO88384 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Vti1bO88384 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Vti1bO88384 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Vti1bO88384 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Vti1bO88384 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Vti1bO88384 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Vti1bO88384 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Vti1bO88384 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Vti1bO88384 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Vti1bO88384 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Vti1bO88384 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Vti1bO88384 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Vti1bO88384 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Vti1bO88384 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Vti1bO88384 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Vti1bO88384 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Vti1bO88384 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Vti1bO88384 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Vti1bO88384 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Vti1bO88384 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Vti1bO88384 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Vti1bO88384 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Vti1bO88384 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Vti1bO88384 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Vti1bO88384 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Vti1bO88384 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Vti1bO88384 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Vti1bO88384 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Vti1bO88384 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Vti1bO88384 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Vti1bO88384 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Vti1bO88384 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Vti1bO88384 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Vti1bO88384 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Vti1bO88384 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Vti1bO88384 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Vti1bO88384 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Vti1bO88384 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Vti1bO88384 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Vti1bO88384 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Vti1bO88384 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Vti1bO88384 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Vti1bO88384 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Vti1bO88384 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Vti1bO88384 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Vti1bO88384 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Vti1bO88384 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Vti1bO88384 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Vti1bO88384 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Vti1bO88384 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Vti1bO88384 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Vti1bO88384 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Vti1bO88384 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Vti1bO88384 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Vti1bO88384 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Vti1bO88384 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Vti1bO88384 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Vti1bO88384 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Vti1bO88384 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Vti1bO88384 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Vti1bO88384 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Vti1bO88384 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.2 ms