Protein–RNA interactions for Protein: O88327

Ctnnal1, Alpha-catulin, mousemouse

Predictions only

Length 731 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnnal1O88327 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ctnnal1O88327 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ctnnal1O88327 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ctnnal1O88327 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ctnnal1O88327 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ctnnal1O88327 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ctnnal1O88327 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ctnnal1O88327 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ctnnal1O88327 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ctnnal1O88327 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ctnnal1O88327 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ctnnal1O88327 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ctnnal1O88327 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ctnnal1O88327 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ctnnal1O88327 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ctnnal1O88327 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ctnnal1O88327 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ctnnal1O88327 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ctnnal1O88327 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ctnnal1O88327 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ctnnal1O88327 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ctnnal1O88327 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ctnnal1O88327 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ctnnal1O88327 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Ctnnal1O88327 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ctnnal1O88327 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ctnnal1O88327 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ctnnal1O88327 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ctnnal1O88327 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ctnnal1O88327 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ctnnal1O88327 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ctnnal1O88327 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ctnnal1O88327 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ctnnal1O88327 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ctnnal1O88327 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ctnnal1O88327 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Ctnnal1O88327 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ctnnal1O88327 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ctnnal1O88327 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ctnnal1O88327 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ctnnal1O88327 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ctnnal1O88327 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ctnnal1O88327 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ctnnal1O88327 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ctnnal1O88327 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ctnnal1O88327 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ctnnal1O88327 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ctnnal1O88327 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ctnnal1O88327 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ctnnal1O88327 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ctnnal1O88327 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ctnnal1O88327 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ctnnal1O88327 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Ctnnal1O88327 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ctnnal1O88327 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ctnnal1O88327 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ctnnal1O88327 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ctnnal1O88327 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ctnnal1O88327 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ctnnal1O88327 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ctnnal1O88327 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ctnnal1O88327 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ctnnal1O88327 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ctnnal1O88327 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ctnnal1O88327 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ctnnal1O88327 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ctnnal1O88327 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Ctnnal1O88327 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Ctnnal1O88327 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ctnnal1O88327 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ctnnal1O88327 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ctnnal1O88327 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ctnnal1O88327 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ctnnal1O88327 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Ctnnal1O88327 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ctnnal1O88327 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ctnnal1O88327 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ctnnal1O88327 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ctnnal1O88327 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ctnnal1O88327 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ctnnal1O88327 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ctnnal1O88327 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ctnnal1O88327 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ctnnal1O88327 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ctnnal1O88327 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ctnnal1O88327 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ctnnal1O88327 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ctnnal1O88327 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ctnnal1O88327 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ctnnal1O88327 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ctnnal1O88327 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ctnnal1O88327 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ctnnal1O88327 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ctnnal1O88327 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ctnnal1O88327 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Ctnnal1O88327 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ctnnal1O88327 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ctnnal1O88327 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Ctnnal1O88327 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ctnnal1O88327 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.8 ms