Protein–RNA interactions for Protein: O70309

Itgb5, Integrin beta-5, mousemouse

Predictions only

Length 798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb5O70309 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Itgb5O70309 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Itgb5O70309 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Itgb5O70309 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Itgb5O70309 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Itgb5O70309 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Itgb5O70309 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Itgb5O70309 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Itgb5O70309 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Itgb5O70309 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Itgb5O70309 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Itgb5O70309 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Itgb5O70309 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Itgb5O70309 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Itgb5O70309 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Itgb5O70309 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Itgb5O70309 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Itgb5O70309 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Itgb5O70309 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Itgb5O70309 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
Itgb5O70309 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Itgb5O70309 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Itgb5O70309 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Itgb5O70309 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Itgb5O70309 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Itgb5O70309 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Itgb5O70309 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Itgb5O70309 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Itgb5O70309 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Itgb5O70309 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Itgb5O70309 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Itgb5O70309 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Itgb5O70309 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Itgb5O70309 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Itgb5O70309 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Itgb5O70309 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Itgb5O70309 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Itgb5O70309 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Itgb5O70309 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Itgb5O70309 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Itgb5O70309 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Itgb5O70309 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Itgb5O70309 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Itgb5O70309 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Itgb5O70309 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Itgb5O70309 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Itgb5O70309 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Itgb5O70309 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Itgb5O70309 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Itgb5O70309 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Itgb5O70309 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Itgb5O70309 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Itgb5O70309 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Itgb5O70309 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Itgb5O70309 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Itgb5O70309 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Itgb5O70309 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
Itgb5O70309 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Itgb5O70309 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Itgb5O70309 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Itgb5O70309 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Itgb5O70309 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Itgb5O70309 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC23.83■■□□□ 1.4
Itgb5O70309 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Itgb5O70309 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Itgb5O70309 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Itgb5O70309 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Itgb5O70309 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Itgb5O70309 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Itgb5O70309 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Itgb5O70309 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Itgb5O70309 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Itgb5O70309 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Itgb5O70309 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Itgb5O70309 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Itgb5O70309 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Itgb5O70309 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Itgb5O70309 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Itgb5O70309 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Itgb5O70309 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Itgb5O70309 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Itgb5O70309 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Itgb5O70309 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Itgb5O70309 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Itgb5O70309 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Itgb5O70309 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Itgb5O70309 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Itgb5O70309 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Itgb5O70309 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Itgb5O70309 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Itgb5O70309 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Itgb5O70309 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Itgb5O70309 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Itgb5O70309 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Itgb5O70309 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Itgb5O70309 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Itgb5O70309 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Itgb5O70309 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Itgb5O70309 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Itgb5O70309 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms