Protein–RNA interactions for Protein: O55203

Ldb2, LIM domain-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ldb2O55203 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Ldb2O55203 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Ldb2O55203 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ldb2O55203 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ldb2O55203 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Ldb2O55203 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ldb2O55203 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ldb2O55203 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Ldb2O55203 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ldb2O55203 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Ldb2O55203 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ldb2O55203 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ldb2O55203 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ldb2O55203 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Ldb2O55203 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ldb2O55203 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ldb2O55203 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Ldb2O55203 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ldb2O55203 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Ldb2O55203 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ldb2O55203 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ldb2O55203 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Ldb2O55203 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Ldb2O55203 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ldb2O55203 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ldb2O55203 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ldb2O55203 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ldb2O55203 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ldb2O55203 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Ldb2O55203 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ldb2O55203 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ldb2O55203 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ldb2O55203 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Ldb2O55203 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ldb2O55203 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ldb2O55203 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ldb2O55203 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Ldb2O55203 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ldb2O55203 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ldb2O55203 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ldb2O55203 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ldb2O55203 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ldb2O55203 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ldb2O55203 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ldb2O55203 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ldb2O55203 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ldb2O55203 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ldb2O55203 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ldb2O55203 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ldb2O55203 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ldb2O55203 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ldb2O55203 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ldb2O55203 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ldb2O55203 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ldb2O55203 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ldb2O55203 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ldb2O55203 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ldb2O55203 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ldb2O55203 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ldb2O55203 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ldb2O55203 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ldb2O55203 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ldb2O55203 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ldb2O55203 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ldb2O55203 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ldb2O55203 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ldb2O55203 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ldb2O55203 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ldb2O55203 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Ldb2O55203 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ldb2O55203 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Ldb2O55203 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ldb2O55203 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ldb2O55203 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ldb2O55203 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ldb2O55203 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ldb2O55203 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ldb2O55203 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ldb2O55203 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ldb2O55203 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ldb2O55203 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ldb2O55203 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Ldb2O55203 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ldb2O55203 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ldb2O55203 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ldb2O55203 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ldb2O55203 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ldb2O55203 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ldb2O55203 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ldb2O55203 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ldb2O55203 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ldb2O55203 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ldb2O55203 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Ldb2O55203 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ldb2O55203 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ldb2O55203 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ldb2O55203 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ldb2O55203 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Ldb2O55203 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ldb2O55203 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms