Protein–RNA interactions for Protein: O55142

Rpl35a, 60S ribosomal protein L35a, mousemouse

Predictions only

Length 110 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl35aO55142 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rpl35aO55142 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rpl35aO55142 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rpl35aO55142 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rpl35aO55142 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rpl35aO55142 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rpl35aO55142 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rpl35aO55142 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rpl35aO55142 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rpl35aO55142 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rpl35aO55142 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rpl35aO55142 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rpl35aO55142 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rpl35aO55142 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rpl35aO55142 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rpl35aO55142 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Rpl35aO55142 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rpl35aO55142 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rpl35aO55142 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rpl35aO55142 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rpl35aO55142 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rpl35aO55142 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rpl35aO55142 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rpl35aO55142 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rpl35aO55142 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rpl35aO55142 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rpl35aO55142 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rpl35aO55142 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rpl35aO55142 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rpl35aO55142 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rpl35aO55142 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rpl35aO55142 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rpl35aO55142 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rpl35aO55142 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rpl35aO55142 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rpl35aO55142 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rpl35aO55142 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rpl35aO55142 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Rpl35aO55142 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rpl35aO55142 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rpl35aO55142 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rpl35aO55142 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rpl35aO55142 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rpl35aO55142 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rpl35aO55142 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rpl35aO55142 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rpl35aO55142 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rpl35aO55142 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rpl35aO55142 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rpl35aO55142 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rpl35aO55142 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rpl35aO55142 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rpl35aO55142 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rpl35aO55142 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rpl35aO55142 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rpl35aO55142 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rpl35aO55142 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rpl35aO55142 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rpl35aO55142 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rpl35aO55142 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rpl35aO55142 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rpl35aO55142 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rpl35aO55142 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rpl35aO55142 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rpl35aO55142 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rpl35aO55142 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rpl35aO55142 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rpl35aO55142 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rpl35aO55142 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rpl35aO55142 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rpl35aO55142 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Rpl35aO55142 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rpl35aO55142 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rpl35aO55142 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rpl35aO55142 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rpl35aO55142 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rpl35aO55142 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Rpl35aO55142 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rpl35aO55142 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rpl35aO55142 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rpl35aO55142 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rpl35aO55142 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rpl35aO55142 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rpl35aO55142 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rpl35aO55142 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rpl35aO55142 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rpl35aO55142 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rpl35aO55142 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rpl35aO55142 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rpl35aO55142 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rpl35aO55142 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rpl35aO55142 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rpl35aO55142 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Rpl35aO55142 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rpl35aO55142 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rpl35aO55142 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rpl35aO55142 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rpl35aO55142 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Rpl35aO55142 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rpl35aO55142 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms