Protein–RNA interactions for Protein: O55126

Nipsnap2, Protein NipSnap homolog 2, mousemouse

Predictions only

Length 281 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nipsnap2O55126 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nipsnap2O55126 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nipsnap2O55126 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nipsnap2O55126 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nipsnap2O55126 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nipsnap2O55126 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nipsnap2O55126 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nipsnap2O55126 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Nipsnap2O55126 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Nipsnap2O55126 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Nipsnap2O55126 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Nipsnap2O55126 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Nipsnap2O55126 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Nipsnap2O55126 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Nipsnap2O55126 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Nipsnap2O55126 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Nipsnap2O55126 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Nipsnap2O55126 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Nipsnap2O55126 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Nipsnap2O55126 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Nipsnap2O55126 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Nipsnap2O55126 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Nipsnap2O55126 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Nipsnap2O55126 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Nipsnap2O55126 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Nipsnap2O55126 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Nipsnap2O55126 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Nipsnap2O55126 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Nipsnap2O55126 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Nipsnap2O55126 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Nipsnap2O55126 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Nipsnap2O55126 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Nipsnap2O55126 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Nipsnap2O55126 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Nipsnap2O55126 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Nipsnap2O55126 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Nipsnap2O55126 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Nipsnap2O55126 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Nipsnap2O55126 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Nipsnap2O55126 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Nipsnap2O55126 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Nipsnap2O55126 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Nipsnap2O55126 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Nipsnap2O55126 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Nipsnap2O55126 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Nipsnap2O55126 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Nipsnap2O55126 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Nipsnap2O55126 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Nipsnap2O55126 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Nipsnap2O55126 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Nipsnap2O55126 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Nipsnap2O55126 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Nipsnap2O55126 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Nipsnap2O55126 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Nipsnap2O55126 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Nipsnap2O55126 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Nipsnap2O55126 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Nipsnap2O55126 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Nipsnap2O55126 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Nipsnap2O55126 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Nipsnap2O55126 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Nipsnap2O55126 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Nipsnap2O55126 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Nipsnap2O55126 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Nipsnap2O55126 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Nipsnap2O55126 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Nipsnap2O55126 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Nipsnap2O55126 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Nipsnap2O55126 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Nipsnap2O55126 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Nipsnap2O55126 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Nipsnap2O55126 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Nipsnap2O55126 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Nipsnap2O55126 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Nipsnap2O55126 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Nipsnap2O55126 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Nipsnap2O55126 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Nipsnap2O55126 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Nipsnap2O55126 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Nipsnap2O55126 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Nipsnap2O55126 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Nipsnap2O55126 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Nipsnap2O55126 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Nipsnap2O55126 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Nipsnap2O55126 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Nipsnap2O55126 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Nipsnap2O55126 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Nipsnap2O55126 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
Nipsnap2O55126 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Nipsnap2O55126 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Nipsnap2O55126 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Nipsnap2O55126 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Nipsnap2O55126 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Nipsnap2O55126 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Nipsnap2O55126 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Nipsnap2O55126 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Nipsnap2O55126 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Nipsnap2O55126 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Nipsnap2O55126 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Nipsnap2O55126 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms