Protein–RNA interactions for Protein: O55101

Syngr2, Synaptogyrin-2, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syngr2O55101 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Syngr2O55101 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Syngr2O55101 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Syngr2O55101 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Syngr2O55101 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Syngr2O55101 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Syngr2O55101 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Syngr2O55101 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Syngr2O55101 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Syngr2O55101 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Syngr2O55101 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Syngr2O55101 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Syngr2O55101 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Syngr2O55101 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Syngr2O55101 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Syngr2O55101 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Syngr2O55101 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Syngr2O55101 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Syngr2O55101 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Syngr2O55101 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Syngr2O55101 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Syngr2O55101 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Syngr2O55101 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Syngr2O55101 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Syngr2O55101 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Syngr2O55101 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Syngr2O55101 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Syngr2O55101 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Syngr2O55101 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Syngr2O55101 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Syngr2O55101 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Syngr2O55101 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Syngr2O55101 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Syngr2O55101 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Syngr2O55101 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Syngr2O55101 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Syngr2O55101 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Syngr2O55101 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Syngr2O55101 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Syngr2O55101 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Syngr2O55101 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Syngr2O55101 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Syngr2O55101 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Syngr2O55101 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Syngr2O55101 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Syngr2O55101 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Syngr2O55101 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Syngr2O55101 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Syngr2O55101 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Syngr2O55101 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Syngr2O55101 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Syngr2O55101 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Syngr2O55101 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Syngr2O55101 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Syngr2O55101 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Syngr2O55101 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Syngr2O55101 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Syngr2O55101 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Syngr2O55101 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Syngr2O55101 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Syngr2O55101 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Syngr2O55101 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Syngr2O55101 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Syngr2O55101 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Syngr2O55101 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Syngr2O55101 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Syngr2O55101 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Syngr2O55101 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Syngr2O55101 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Syngr2O55101 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Syngr2O55101 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Syngr2O55101 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Syngr2O55101 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Syngr2O55101 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Syngr2O55101 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Syngr2O55101 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Syngr2O55101 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Syngr2O55101 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Syngr2O55101 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Syngr2O55101 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Syngr2O55101 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Syngr2O55101 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Syngr2O55101 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Syngr2O55101 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Syngr2O55101 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Syngr2O55101 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Syngr2O55101 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Syngr2O55101 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Syngr2O55101 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Syngr2O55101 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Syngr2O55101 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Syngr2O55101 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Syngr2O55101 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Syngr2O55101 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Syngr2O55101 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Syngr2O55101 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Syngr2O55101 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Syngr2O55101 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Syngr2O55101 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Syngr2O55101 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.9 ms