Protein–RNA interactions for Protein: O54956

Pole2, DNA polymerase epsilon subunit 2, mousemouse

Predictions only

Length 527 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pole2O54956 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Pole2O54956 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Pole2O54956 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Pole2O54956 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Pole2O54956 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Pole2O54956 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Pole2O54956 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Pole2O54956 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Pole2O54956 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Pole2O54956 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Pole2O54956 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Pole2O54956 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Pole2O54956 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Pole2O54956 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Pole2O54956 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Pole2O54956 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Pole2O54956 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Pole2O54956 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Pole2O54956 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Pole2O54956 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Pole2O54956 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Pole2O54956 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Pole2O54956 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Pole2O54956 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Pole2O54956 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Pole2O54956 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Pole2O54956 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Pole2O54956 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Pole2O54956 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Pole2O54956 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Pole2O54956 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Pole2O54956 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Pole2O54956 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Pole2O54956 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Pole2O54956 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Pole2O54956 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Pole2O54956 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Pole2O54956 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Pole2O54956 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Pole2O54956 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Pole2O54956 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Pole2O54956 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Pole2O54956 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Pole2O54956 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Pole2O54956 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Pole2O54956 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Pole2O54956 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Pole2O54956 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Pole2O54956 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Pole2O54956 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Pole2O54956 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Pole2O54956 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Pole2O54956 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Pole2O54956 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Pole2O54956 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Pole2O54956 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Pole2O54956 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Pole2O54956 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Pole2O54956 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Pole2O54956 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Pole2O54956 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Pole2O54956 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Pole2O54956 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Pole2O54956 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Pole2O54956 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Pole2O54956 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Pole2O54956 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Pole2O54956 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Pole2O54956 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Pole2O54956 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Pole2O54956 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Pole2O54956 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Pole2O54956 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Pole2O54956 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Pole2O54956 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Pole2O54956 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Pole2O54956 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Pole2O54956 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Pole2O54956 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Pole2O54956 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Pole2O54956 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Pole2O54956 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Pole2O54956 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Pole2O54956 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Pole2O54956 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Pole2O54956 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Pole2O54956 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Pole2O54956 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Pole2O54956 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Pole2O54956 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Pole2O54956 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Pole2O54956 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Pole2O54956 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Pole2O54956 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Pole2O54956 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Pole2O54956 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Pole2O54956 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Pole2O54956 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Pole2O54956 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Pole2O54956 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.1 ms