Protein–RNA interactions for Protein: O54901

Cd200, OX-2 membrane glycoprotein, mousemouse

Predictions only

Length 278 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd200O54901 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cd200O54901 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cd200O54901 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cd200O54901 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cd200O54901 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cd200O54901 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cd200O54901 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cd200O54901 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cd200O54901 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cd200O54901 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Cd200O54901 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cd200O54901 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cd200O54901 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cd200O54901 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cd200O54901 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cd200O54901 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cd200O54901 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cd200O54901 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cd200O54901 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Cd200O54901 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cd200O54901 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cd200O54901 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cd200O54901 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cd200O54901 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cd200O54901 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cd200O54901 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cd200O54901 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cd200O54901 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cd200O54901 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cd200O54901 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cd200O54901 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cd200O54901 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cd200O54901 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cd200O54901 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cd200O54901 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cd200O54901 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cd200O54901 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cd200O54901 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cd200O54901 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cd200O54901 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cd200O54901 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cd200O54901 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cd200O54901 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cd200O54901 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cd200O54901 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cd200O54901 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cd200O54901 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cd200O54901 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cd200O54901 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cd200O54901 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cd200O54901 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cd200O54901 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cd200O54901 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cd200O54901 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cd200O54901 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Cd200O54901 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Cd200O54901 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cd200O54901 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cd200O54901 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cd200O54901 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cd200O54901 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cd200O54901 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cd200O54901 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cd200O54901 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cd200O54901 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cd200O54901 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cd200O54901 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cd200O54901 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cd200O54901 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cd200O54901 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cd200O54901 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Cd200O54901 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Cd200O54901 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cd200O54901 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cd200O54901 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cd200O54901 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cd200O54901 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cd200O54901 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cd200O54901 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cd200O54901 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cd200O54901 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cd200O54901 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Cd200O54901 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cd200O54901 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cd200O54901 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cd200O54901 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cd200O54901 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cd200O54901 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cd200O54901 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cd200O54901 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cd200O54901 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cd200O54901 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cd200O54901 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Cd200O54901 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cd200O54901 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cd200O54901 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cd200O54901 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cd200O54901 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cd200O54901 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cd200O54901 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.3 ms