Protein–RNA interactions for Protein: O54839

Eomes, Eomesodermin homolog, mousemouse

Predictions only

Length 707 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EomesO54839 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
EomesO54839 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
EomesO54839 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
EomesO54839 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
EomesO54839 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
EomesO54839 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
EomesO54839 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
EomesO54839 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
EomesO54839 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
EomesO54839 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
EomesO54839 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
EomesO54839 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
EomesO54839 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
EomesO54839 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
EomesO54839 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
EomesO54839 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
EomesO54839 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
EomesO54839 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
EomesO54839 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
EomesO54839 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
EomesO54839 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
EomesO54839 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
EomesO54839 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
EomesO54839 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
EomesO54839 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
EomesO54839 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
EomesO54839 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
EomesO54839 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
EomesO54839 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
EomesO54839 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
EomesO54839 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
EomesO54839 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
EomesO54839 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
EomesO54839 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
EomesO54839 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
EomesO54839 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
EomesO54839 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
EomesO54839 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
EomesO54839 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
EomesO54839 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
EomesO54839 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
EomesO54839 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
EomesO54839 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
EomesO54839 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
EomesO54839 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
EomesO54839 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
EomesO54839 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
EomesO54839 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
EomesO54839 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
EomesO54839 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
EomesO54839 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
EomesO54839 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
EomesO54839 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
EomesO54839 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
EomesO54839 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
EomesO54839 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
EomesO54839 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
EomesO54839 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
EomesO54839 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
EomesO54839 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
EomesO54839 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
EomesO54839 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
EomesO54839 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
EomesO54839 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
EomesO54839 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
EomesO54839 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
EomesO54839 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
EomesO54839 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
EomesO54839 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
EomesO54839 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
EomesO54839 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
EomesO54839 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
EomesO54839 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
EomesO54839 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
EomesO54839 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
EomesO54839 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
EomesO54839 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
EomesO54839 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
EomesO54839 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
EomesO54839 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
EomesO54839 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
EomesO54839 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
EomesO54839 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
EomesO54839 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
EomesO54839 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
EomesO54839 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
EomesO54839 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
EomesO54839 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
EomesO54839 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
EomesO54839 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
EomesO54839 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
EomesO54839 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
EomesO54839 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
EomesO54839 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
EomesO54839 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
EomesO54839 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
EomesO54839 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
EomesO54839 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
EomesO54839 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
EomesO54839 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms