Protein–RNA interactions for Protein: O54833

Csnk2a2, Casein kinase II subunit alpha', mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnk2a2O54833 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Csnk2a2O54833 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Csnk2a2O54833 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Csnk2a2O54833 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Csnk2a2O54833 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Csnk2a2O54833 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Csnk2a2O54833 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Csnk2a2O54833 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Csnk2a2O54833 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Csnk2a2O54833 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Csnk2a2O54833 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Csnk2a2O54833 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Csnk2a2O54833 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Csnk2a2O54833 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Csnk2a2O54833 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Csnk2a2O54833 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Csnk2a2O54833 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Csnk2a2O54833 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Csnk2a2O54833 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Csnk2a2O54833 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Csnk2a2O54833 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Csnk2a2O54833 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Csnk2a2O54833 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Csnk2a2O54833 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Csnk2a2O54833 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Csnk2a2O54833 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Csnk2a2O54833 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Csnk2a2O54833 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Csnk2a2O54833 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Csnk2a2O54833 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Csnk2a2O54833 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Csnk2a2O54833 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Csnk2a2O54833 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Csnk2a2O54833 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Csnk2a2O54833 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Csnk2a2O54833 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Csnk2a2O54833 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Csnk2a2O54833 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Csnk2a2O54833 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Csnk2a2O54833 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Csnk2a2O54833 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Csnk2a2O54833 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Csnk2a2O54833 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Csnk2a2O54833 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Csnk2a2O54833 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Csnk2a2O54833 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
Csnk2a2O54833 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Csnk2a2O54833 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Csnk2a2O54833 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Csnk2a2O54833 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Csnk2a2O54833 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Csnk2a2O54833 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Csnk2a2O54833 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Csnk2a2O54833 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Csnk2a2O54833 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Csnk2a2O54833 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Csnk2a2O54833 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Csnk2a2O54833 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Csnk2a2O54833 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Csnk2a2O54833 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Csnk2a2O54833 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Csnk2a2O54833 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Csnk2a2O54833 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Csnk2a2O54833 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Csnk2a2O54833 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Csnk2a2O54833 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Csnk2a2O54833 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Csnk2a2O54833 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Csnk2a2O54833 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Csnk2a2O54833 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Csnk2a2O54833 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Csnk2a2O54833 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Csnk2a2O54833 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Csnk2a2O54833 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Csnk2a2O54833 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Csnk2a2O54833 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Csnk2a2O54833 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Csnk2a2O54833 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Csnk2a2O54833 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Csnk2a2O54833 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Csnk2a2O54833 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Csnk2a2O54833 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Csnk2a2O54833 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Csnk2a2O54833 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Csnk2a2O54833 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Csnk2a2O54833 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Csnk2a2O54833 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Csnk2a2O54833 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Csnk2a2O54833 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Csnk2a2O54833 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Csnk2a2O54833 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Csnk2a2O54833 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Csnk2a2O54833 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Csnk2a2O54833 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Csnk2a2O54833 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Csnk2a2O54833 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Csnk2a2O54833 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Csnk2a2O54833 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Csnk2a2O54833 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Csnk2a2O54833 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13 ms