Protein–RNA interactions for Protein: O35963

Rab33b, Ras-related protein Rab-33B, mousemouse

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab33bO35963 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rab33bO35963 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rab33bO35963 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rab33bO35963 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rab33bO35963 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rab33bO35963 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Rab33bO35963 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rab33bO35963 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rab33bO35963 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rab33bO35963 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rab33bO35963 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rab33bO35963 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rab33bO35963 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Rab33bO35963 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rab33bO35963 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rab33bO35963 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rab33bO35963 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Rab33bO35963 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rab33bO35963 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rab33bO35963 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rab33bO35963 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rab33bO35963 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rab33bO35963 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Rab33bO35963 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rab33bO35963 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rab33bO35963 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rab33bO35963 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rab33bO35963 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rab33bO35963 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rab33bO35963 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rab33bO35963 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rab33bO35963 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rab33bO35963 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rab33bO35963 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rab33bO35963 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rab33bO35963 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rab33bO35963 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Rab33bO35963 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rab33bO35963 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rab33bO35963 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rab33bO35963 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rab33bO35963 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rab33bO35963 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rab33bO35963 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rab33bO35963 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rab33bO35963 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rab33bO35963 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rab33bO35963 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Rab33bO35963 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rab33bO35963 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rab33bO35963 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rab33bO35963 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rab33bO35963 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rab33bO35963 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Rab33bO35963 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rab33bO35963 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rab33bO35963 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rab33bO35963 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rab33bO35963 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rab33bO35963 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rab33bO35963 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Rab33bO35963 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Rab33bO35963 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rab33bO35963 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rab33bO35963 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rab33bO35963 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rab33bO35963 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rab33bO35963 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rab33bO35963 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rab33bO35963 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rab33bO35963 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rab33bO35963 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rab33bO35963 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rab33bO35963 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rab33bO35963 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Rab33bO35963 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Rab33bO35963 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Rab33bO35963 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rab33bO35963 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rab33bO35963 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Rab33bO35963 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Rab33bO35963 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rab33bO35963 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rab33bO35963 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rab33bO35963 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rab33bO35963 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rab33bO35963 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rab33bO35963 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rab33bO35963 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rab33bO35963 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rab33bO35963 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rab33bO35963 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rab33bO35963 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rab33bO35963 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rab33bO35963 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rab33bO35963 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rab33bO35963 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rab33bO35963 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rab33bO35963 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rab33bO35963 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.2 ms