Protein–RNA interactions for Protein: O35711

Ppfibp2, Liprin-beta-2, mousemouse

Predictions only

Length 882 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppfibp2O35711 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC27.53■■■□□ 2
Ppfibp2O35711 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC27.53■■■□□ 2
Ppfibp2O35711 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Ppfibp2O35711 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Ppfibp2O35711 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Ppfibp2O35711 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Ppfibp2O35711 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Ppfibp2O35711 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Ppfibp2O35711 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC27.52■■■□□ 2
Ppfibp2O35711 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC27.52■■■□□ 2
Ppfibp2O35711 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Ppfibp2O35711 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Ppfibp2O35711 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Ppfibp2O35711 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Ppfibp2O35711 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Ppfibp2O35711 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Ppfibp2O35711 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Ppfibp2O35711 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Ppfibp2O35711 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Ppfibp2O35711 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Ppfibp2O35711 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Ppfibp2O35711 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
Ppfibp2O35711 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Ppfibp2O35711 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Ppfibp2O35711 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Ppfibp2O35711 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Ppfibp2O35711 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Ppfibp2O35711 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Ppfibp2O35711 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Ppfibp2O35711 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Ppfibp2O35711 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Ppfibp2O35711 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Ppfibp2O35711 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Ppfibp2O35711 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Ppfibp2O35711 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Ppfibp2O35711 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Ppfibp2O35711 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Ppfibp2O35711 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Ppfibp2O35711 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Ppfibp2O35711 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
Ppfibp2O35711 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Ppfibp2O35711 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
Ppfibp2O35711 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Ppfibp2O35711 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Ppfibp2O35711 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Ppfibp2O35711 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Ppfibp2O35711 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Ppfibp2O35711 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Ppfibp2O35711 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Ppfibp2O35711 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Ppfibp2O35711 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Ppfibp2O35711 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Ppfibp2O35711 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Ppfibp2O35711 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Ppfibp2O35711 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Ppfibp2O35711 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Ppfibp2O35711 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Ppfibp2O35711 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Ppfibp2O35711 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Ppfibp2O35711 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Ppfibp2O35711 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Ppfibp2O35711 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Ppfibp2O35711 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Ppfibp2O35711 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Ppfibp2O35711 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Ppfibp2O35711 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Ppfibp2O35711 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Ppfibp2O35711 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Ppfibp2O35711 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Ppfibp2O35711 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Ppfibp2O35711 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Ppfibp2O35711 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Ppfibp2O35711 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Ppfibp2O35711 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Ppfibp2O35711 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Ppfibp2O35711 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Ppfibp2O35711 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Ppfibp2O35711 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Ppfibp2O35711 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Ppfibp2O35711 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Ppfibp2O35711 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Ppfibp2O35711 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Ppfibp2O35711 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Ppfibp2O35711 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Ppfibp2O35711 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Ppfibp2O35711 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Ppfibp2O35711 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Ppfibp2O35711 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Ppfibp2O35711 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Ppfibp2O35711 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Ppfibp2O35711 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Ppfibp2O35711 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Ppfibp2O35711 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Ppfibp2O35711 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
Ppfibp2O35711 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Ppfibp2O35711 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Ppfibp2O35711 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Ppfibp2O35711 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
Ppfibp2O35711 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Ppfibp2O35711 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60 ms