Protein–RNA interactions for Protein: O35599

Opn1mw, Medium-wave-sensitive opsin 1, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Opn1mwO35599 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Opn1mwO35599 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Opn1mwO35599 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Opn1mwO35599 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Opn1mwO35599 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Opn1mwO35599 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Opn1mwO35599 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Opn1mwO35599 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Opn1mwO35599 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Opn1mwO35599 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Opn1mwO35599 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Opn1mwO35599 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Opn1mwO35599 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Opn1mwO35599 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Opn1mwO35599 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Opn1mwO35599 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Opn1mwO35599 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Opn1mwO35599 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Opn1mwO35599 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Opn1mwO35599 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Opn1mwO35599 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Opn1mwO35599 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Opn1mwO35599 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Opn1mwO35599 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Opn1mwO35599 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Opn1mwO35599 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Opn1mwO35599 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Opn1mwO35599 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Opn1mwO35599 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Opn1mwO35599 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Opn1mwO35599 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Opn1mwO35599 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Opn1mwO35599 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Opn1mwO35599 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Opn1mwO35599 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Opn1mwO35599 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Opn1mwO35599 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Opn1mwO35599 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Opn1mwO35599 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Opn1mwO35599 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Opn1mwO35599 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Opn1mwO35599 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Opn1mwO35599 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Opn1mwO35599 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Opn1mwO35599 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Opn1mwO35599 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Opn1mwO35599 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Opn1mwO35599 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Opn1mwO35599 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Opn1mwO35599 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Opn1mwO35599 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Opn1mwO35599 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Opn1mwO35599 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Opn1mwO35599 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Opn1mwO35599 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Opn1mwO35599 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Opn1mwO35599 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Opn1mwO35599 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Opn1mwO35599 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Opn1mwO35599 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Opn1mwO35599 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Opn1mwO35599 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Opn1mwO35599 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Opn1mwO35599 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Opn1mwO35599 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Opn1mwO35599 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Opn1mwO35599 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Opn1mwO35599 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Opn1mwO35599 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Opn1mwO35599 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Opn1mwO35599 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Opn1mwO35599 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Opn1mwO35599 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Opn1mwO35599 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Opn1mwO35599 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Opn1mwO35599 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Opn1mwO35599 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Opn1mwO35599 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Opn1mwO35599 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Opn1mwO35599 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Opn1mwO35599 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Opn1mwO35599 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Opn1mwO35599 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Opn1mwO35599 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Opn1mwO35599 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Opn1mwO35599 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Opn1mwO35599 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Opn1mwO35599 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Opn1mwO35599 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Opn1mwO35599 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Opn1mwO35599 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Opn1mwO35599 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Opn1mwO35599 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Opn1mwO35599 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Opn1mwO35599 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Opn1mwO35599 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Opn1mwO35599 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Opn1mwO35599 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Opn1mwO35599 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Opn1mwO35599 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15 ms