Protein–RNA interactions for Protein: O35595

Ptch2, Protein patched homolog 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,182 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptch2O35595 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ptch2O35595 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ptch2O35595 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ptch2O35595 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ptch2O35595 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ptch2O35595 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ptch2O35595 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ptch2O35595 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ptch2O35595 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ptch2O35595 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ptch2O35595 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ptch2O35595 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ptch2O35595 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ptch2O35595 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Ptch2O35595 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ptch2O35595 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ptch2O35595 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ptch2O35595 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ptch2O35595 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ptch2O35595 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ptch2O35595 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ptch2O35595 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ptch2O35595 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ptch2O35595 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ptch2O35595 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ptch2O35595 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ptch2O35595 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ptch2O35595 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ptch2O35595 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ptch2O35595 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ptch2O35595 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ptch2O35595 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ptch2O35595 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ptch2O35595 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ptch2O35595 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ptch2O35595 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ptch2O35595 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ptch2O35595 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ptch2O35595 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ptch2O35595 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ptch2O35595 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ptch2O35595 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ptch2O35595 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ptch2O35595 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ptch2O35595 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ptch2O35595 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ptch2O35595 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Ptch2O35595 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Ptch2O35595 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ptch2O35595 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Ptch2O35595 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ptch2O35595 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ptch2O35595 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ptch2O35595 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ptch2O35595 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ptch2O35595 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Ptch2O35595 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ptch2O35595 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Ptch2O35595 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ptch2O35595 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ptch2O35595 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ptch2O35595 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ptch2O35595 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ptch2O35595 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ptch2O35595 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ptch2O35595 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ptch2O35595 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ptch2O35595 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ptch2O35595 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ptch2O35595 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ptch2O35595 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ptch2O35595 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ptch2O35595 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ptch2O35595 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Ptch2O35595 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ptch2O35595 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ptch2O35595 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ptch2O35595 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ptch2O35595 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ptch2O35595 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ptch2O35595 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ptch2O35595 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ptch2O35595 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ptch2O35595 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ptch2O35595 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ptch2O35595 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ptch2O35595 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Ptch2O35595 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ptch2O35595 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ptch2O35595 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Ptch2O35595 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ptch2O35595 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ptch2O35595 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ptch2O35595 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ptch2O35595 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ptch2O35595 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Ptch2O35595 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ptch2O35595 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ptch2O35595 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ptch2O35595 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
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