Protein–RNA interactions for Protein: O35393

Efnb3, Ephrin-B3, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efnb3O35393 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Efnb3O35393 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Efnb3O35393 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Efnb3O35393 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Efnb3O35393 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Efnb3O35393 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Efnb3O35393 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Efnb3O35393 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Efnb3O35393 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Efnb3O35393 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Efnb3O35393 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Efnb3O35393 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Efnb3O35393 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Efnb3O35393 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Efnb3O35393 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Efnb3O35393 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Efnb3O35393 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Efnb3O35393 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Efnb3O35393 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Efnb3O35393 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Efnb3O35393 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Efnb3O35393 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Efnb3O35393 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Efnb3O35393 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Efnb3O35393 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Efnb3O35393 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Efnb3O35393 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Efnb3O35393 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Efnb3O35393 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Efnb3O35393 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Efnb3O35393 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Efnb3O35393 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Efnb3O35393 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Efnb3O35393 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Efnb3O35393 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Efnb3O35393 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Efnb3O35393 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Efnb3O35393 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Efnb3O35393 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Efnb3O35393 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Efnb3O35393 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Efnb3O35393 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Efnb3O35393 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Efnb3O35393 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Efnb3O35393 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Efnb3O35393 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Efnb3O35393 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Efnb3O35393 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Efnb3O35393 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Efnb3O35393 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Efnb3O35393 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Efnb3O35393 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Efnb3O35393 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Efnb3O35393 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Efnb3O35393 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Efnb3O35393 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Efnb3O35393 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Efnb3O35393 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Efnb3O35393 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Efnb3O35393 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Efnb3O35393 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Efnb3O35393 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Efnb3O35393 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Efnb3O35393 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Efnb3O35393 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Efnb3O35393 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Efnb3O35393 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Efnb3O35393 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Efnb3O35393 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Efnb3O35393 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Efnb3O35393 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Efnb3O35393 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Efnb3O35393 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Efnb3O35393 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Efnb3O35393 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Efnb3O35393 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Efnb3O35393 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Efnb3O35393 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Efnb3O35393 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Efnb3O35393 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Efnb3O35393 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Efnb3O35393 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Efnb3O35393 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Efnb3O35393 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Efnb3O35393 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Efnb3O35393 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Efnb3O35393 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Efnb3O35393 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Efnb3O35393 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Efnb3O35393 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Efnb3O35393 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Efnb3O35393 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Efnb3O35393 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Efnb3O35393 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Efnb3O35393 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Efnb3O35393 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Efnb3O35393 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Efnb3O35393 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Efnb3O35393 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Efnb3O35393 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms