Protein–RNA interactions for Protein: O35347

Dgcr6, Protein DGCR6, mousemouse

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Length 198 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dgcr6O35347 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Dgcr6O35347 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Dgcr6O35347 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Dgcr6O35347 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Dgcr6O35347 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Dgcr6O35347 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Dgcr6O35347 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
Dgcr6O35347 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Dgcr6O35347 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Dgcr6O35347 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Dgcr6O35347 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Dgcr6O35347 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Dgcr6O35347 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Dgcr6O35347 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Dgcr6O35347 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Dgcr6O35347 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Dgcr6O35347 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Dgcr6O35347 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Dgcr6O35347 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Dgcr6O35347 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Dgcr6O35347 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Dgcr6O35347 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Dgcr6O35347 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Dgcr6O35347 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Dgcr6O35347 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Dgcr6O35347 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Dgcr6O35347 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Dgcr6O35347 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Dgcr6O35347 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Dgcr6O35347 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Dgcr6O35347 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Dgcr6O35347 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Dgcr6O35347 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Dgcr6O35347 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Dgcr6O35347 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Dgcr6O35347 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Dgcr6O35347 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Dgcr6O35347 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Dgcr6O35347 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Dgcr6O35347 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Dgcr6O35347 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Dgcr6O35347 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Dgcr6O35347 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Dgcr6O35347 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Dgcr6O35347 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Dgcr6O35347 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Dgcr6O35347 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Dgcr6O35347 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Dgcr6O35347 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Dgcr6O35347 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Dgcr6O35347 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Dgcr6O35347 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Dgcr6O35347 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Dgcr6O35347 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Dgcr6O35347 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Dgcr6O35347 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Dgcr6O35347 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Dgcr6O35347 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Dgcr6O35347 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Dgcr6O35347 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Dgcr6O35347 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Dgcr6O35347 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Dgcr6O35347 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Dgcr6O35347 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
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Dgcr6O35347 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
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Dgcr6O35347 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Dgcr6O35347 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Dgcr6O35347 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Dgcr6O35347 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Dgcr6O35347 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Dgcr6O35347 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Dgcr6O35347 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Dgcr6O35347 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Dgcr6O35347 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC20.64■□□□□ 0.89
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Dgcr6O35347 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Dgcr6O35347 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Dgcr6O35347 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Dgcr6O35347 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Dgcr6O35347 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Dgcr6O35347 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Dgcr6O35347 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Dgcr6O35347 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Dgcr6O35347 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Dgcr6O35347 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Dgcr6O35347 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Dgcr6O35347 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Dgcr6O35347 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Dgcr6O35347 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Dgcr6O35347 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Dgcr6O35347 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Dgcr6O35347 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Dgcr6O35347 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Dgcr6O35347 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Dgcr6O35347 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Dgcr6O35347 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms