Protein–RNA interactions for Protein: O35344

Kpna3, Importin subunit alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 521 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kpna3O35344 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Kpna3O35344 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Kpna3O35344 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Kpna3O35344 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Kpna3O35344 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Kpna3O35344 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Kpna3O35344 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Kpna3O35344 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Kpna3O35344 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Kpna3O35344 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Kpna3O35344 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Kpna3O35344 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Kpna3O35344 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Kpna3O35344 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Kpna3O35344 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Kpna3O35344 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Kpna3O35344 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Kpna3O35344 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Kpna3O35344 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Kpna3O35344 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Kpna3O35344 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Kpna3O35344 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Kpna3O35344 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Kpna3O35344 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Kpna3O35344 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Kpna3O35344 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Kpna3O35344 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Kpna3O35344 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Kpna3O35344 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Kpna3O35344 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Kpna3O35344 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Kpna3O35344 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Kpna3O35344 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Kpna3O35344 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Kpna3O35344 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Kpna3O35344 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Kpna3O35344 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
Kpna3O35344 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Kpna3O35344 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Kpna3O35344 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Kpna3O35344 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Kpna3O35344 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Kpna3O35344 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Kpna3O35344 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Kpna3O35344 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Kpna3O35344 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Kpna3O35344 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Kpna3O35344 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Kpna3O35344 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Kpna3O35344 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Kpna3O35344 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Kpna3O35344 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Kpna3O35344 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Kpna3O35344 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Kpna3O35344 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Kpna3O35344 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
Kpna3O35344 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Kpna3O35344 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Kpna3O35344 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Kpna3O35344 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Kpna3O35344 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Kpna3O35344 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Kpna3O35344 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Kpna3O35344 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Kpna3O35344 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Kpna3O35344 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Kpna3O35344 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Kpna3O35344 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Kpna3O35344 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Kpna3O35344 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Kpna3O35344 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Kpna3O35344 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Kpna3O35344 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Kpna3O35344 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Kpna3O35344 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Kpna3O35344 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Kpna3O35344 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Kpna3O35344 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Kpna3O35344 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Kpna3O35344 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Kpna3O35344 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Kpna3O35344 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Kpna3O35344 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Kpna3O35344 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Kpna3O35344 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Kpna3O35344 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
Kpna3O35344 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Kpna3O35344 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Kpna3O35344 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Kpna3O35344 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
Kpna3O35344 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Kpna3O35344 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Kpna3O35344 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Kpna3O35344 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Kpna3O35344 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Kpna3O35344 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Kpna3O35344 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Kpna3O35344 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Kpna3O35344 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Kpna3O35344 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms