Protein–RNA interactions for Protein: O35231

Kifc3, Kinesin-like protein KIFC3, mousemouse

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Length 824 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kifc3O35231 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Kifc3O35231 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Kifc3O35231 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Kifc3O35231 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Kifc3O35231 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Kifc3O35231 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Kifc3O35231 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Kifc3O35231 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Kifc3O35231 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Kifc3O35231 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Kifc3O35231 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Kifc3O35231 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Kifc3O35231 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Kifc3O35231 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Kifc3O35231 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Kifc3O35231 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Kifc3O35231 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Kifc3O35231 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Kifc3O35231 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Kifc3O35231 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Kifc3O35231 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Kifc3O35231 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Kifc3O35231 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Kifc3O35231 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Kifc3O35231 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Kifc3O35231 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Kifc3O35231 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Kifc3O35231 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Kifc3O35231 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Kifc3O35231 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Kifc3O35231 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Kifc3O35231 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Kifc3O35231 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Kifc3O35231 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Kifc3O35231 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Kifc3O35231 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Kifc3O35231 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Kifc3O35231 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Kifc3O35231 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Kifc3O35231 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Kifc3O35231 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Kifc3O35231 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Kifc3O35231 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Kifc3O35231 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Kifc3O35231 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Kifc3O35231 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Kifc3O35231 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Kifc3O35231 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Kifc3O35231 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Kifc3O35231 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Kifc3O35231 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Kifc3O35231 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Kifc3O35231 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Kifc3O35231 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Kifc3O35231 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Kifc3O35231 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Kifc3O35231 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Kifc3O35231 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Kifc3O35231 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Kifc3O35231 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Kifc3O35231 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Kifc3O35231 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Kifc3O35231 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Kifc3O35231 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Kifc3O35231 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Kifc3O35231 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Kifc3O35231 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Kifc3O35231 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Kifc3O35231 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Kifc3O35231 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Kifc3O35231 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Kifc3O35231 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Kifc3O35231 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Kifc3O35231 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Kifc3O35231 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Kifc3O35231 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Kifc3O35231 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Kifc3O35231 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Kifc3O35231 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Kifc3O35231 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Kifc3O35231 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Kifc3O35231 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Kifc3O35231 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Kifc3O35231 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Kifc3O35231 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Kifc3O35231 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Kifc3O35231 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Kifc3O35231 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Kifc3O35231 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Kifc3O35231 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Kifc3O35231 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Kifc3O35231 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Kifc3O35231 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Kifc3O35231 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Kifc3O35231 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Kifc3O35231 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Kifc3O35231 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Kifc3O35231 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Kifc3O35231 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Kifc3O35231 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms