Protein–RNA interactions for Protein: O35218

Cpsf2, Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 782 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpsf2O35218 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cpsf2O35218 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cpsf2O35218 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cpsf2O35218 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cpsf2O35218 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cpsf2O35218 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cpsf2O35218 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cpsf2O35218 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cpsf2O35218 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cpsf2O35218 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cpsf2O35218 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Cpsf2O35218 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cpsf2O35218 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Cpsf2O35218 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cpsf2O35218 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cpsf2O35218 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cpsf2O35218 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cpsf2O35218 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cpsf2O35218 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cpsf2O35218 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cpsf2O35218 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cpsf2O35218 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cpsf2O35218 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cpsf2O35218 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cpsf2O35218 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cpsf2O35218 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cpsf2O35218 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cpsf2O35218 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Cpsf2O35218 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cpsf2O35218 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cpsf2O35218 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cpsf2O35218 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cpsf2O35218 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cpsf2O35218 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cpsf2O35218 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cpsf2O35218 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cpsf2O35218 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cpsf2O35218 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cpsf2O35218 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cpsf2O35218 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cpsf2O35218 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cpsf2O35218 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cpsf2O35218 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cpsf2O35218 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cpsf2O35218 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cpsf2O35218 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cpsf2O35218 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Cpsf2O35218 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cpsf2O35218 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cpsf2O35218 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cpsf2O35218 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cpsf2O35218 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Cpsf2O35218 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cpsf2O35218 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cpsf2O35218 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cpsf2O35218 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cpsf2O35218 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cpsf2O35218 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cpsf2O35218 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cpsf2O35218 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cpsf2O35218 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cpsf2O35218 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cpsf2O35218 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cpsf2O35218 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cpsf2O35218 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cpsf2O35218 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cpsf2O35218 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cpsf2O35218 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cpsf2O35218 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cpsf2O35218 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cpsf2O35218 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cpsf2O35218 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cpsf2O35218 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cpsf2O35218 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cpsf2O35218 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cpsf2O35218 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cpsf2O35218 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cpsf2O35218 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cpsf2O35218 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cpsf2O35218 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cpsf2O35218 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cpsf2O35218 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cpsf2O35218 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cpsf2O35218 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cpsf2O35218 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cpsf2O35218 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cpsf2O35218 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cpsf2O35218 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cpsf2O35218 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cpsf2O35218 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cpsf2O35218 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cpsf2O35218 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cpsf2O35218 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cpsf2O35218 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cpsf2O35218 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cpsf2O35218 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cpsf2O35218 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cpsf2O35218 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cpsf2O35218 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cpsf2O35218 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.8 ms